Protein–RNA interactions for Protein: P51801

CLCNKB, Chloride channel protein ClC-Kb, humanhuman

Predictions only

Length 687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCNKBP51801 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLCNKBP51801 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLCNKBP51801 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLCNKBP51801 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLCNKBP51801 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLCNKBP51801 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLCNKBP51801 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CLCNKBP51801 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLCNKBP51801 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLCNKBP51801 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLCNKBP51801 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CLCNKBP51801 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLCNKBP51801 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLCNKBP51801 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLCNKBP51801 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLCNKBP51801 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLCNKBP51801 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLCNKBP51801 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLCNKBP51801 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLCNKBP51801 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLCNKBP51801 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLCNKBP51801 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLCNKBP51801 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CLCNKBP51801 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CLCNKBP51801 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLCNKBP51801 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLCNKBP51801 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CLCNKBP51801 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLCNKBP51801 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLCNKBP51801 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLCNKBP51801 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLCNKBP51801 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLCNKBP51801 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLCNKBP51801 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
CLCNKBP51801 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.15
CLCNKBP51801 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CLCNKBP51801 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLCNKBP51801 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLCNKBP51801 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLCNKBP51801 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLCNKBP51801 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLCNKBP51801 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLCNKBP51801 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CLCNKBP51801 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLCNKBP51801 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLCNKBP51801 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CLCNKBP51801 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLCNKBP51801 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLCNKBP51801 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CLCNKBP51801 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CLCNKBP51801 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CLCNKBP51801 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLCNKBP51801 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLCNKBP51801 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLCNKBP51801 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLCNKBP51801 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLCNKBP51801 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLCNKBP51801 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLCNKBP51801 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLCNKBP51801 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CLCNKBP51801 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLCNKBP51801 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLCNKBP51801 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLCNKBP51801 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CLCNKBP51801 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLCNKBP51801 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLCNKBP51801 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLCNKBP51801 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLCNKBP51801 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLCNKBP51801 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLCNKBP51801 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLCNKBP51801 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLCNKBP51801 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLCNKBP51801 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLCNKBP51801 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLCNKBP51801 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLCNKBP51801 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLCNKBP51801 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLCNKBP51801 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLCNKBP51801 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLCNKBP51801 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLCNKBP51801 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLCNKBP51801 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLCNKBP51801 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLCNKBP51801 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLCNKBP51801 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLCNKBP51801 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLCNKBP51801 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLCNKBP51801 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLCNKBP51801 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLCNKBP51801 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLCNKBP51801 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLCNKBP51801 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLCNKBP51801 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLCNKBP51801 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLCNKBP51801 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLCNKBP51801 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLCNKBP51801 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLCNKBP51801 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLCNKBP51801 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms