Protein–RNA interactions for Protein: P49765

VEGFB, Vascular endothelial growth factor B, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFBP49765 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
VEGFBP49765 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
VEGFBP49765 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VEGFBP49765 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
VEGFBP49765 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VEGFBP49765 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VEGFBP49765 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
VEGFBP49765 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VEGFBP49765 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VEGFBP49765 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VEGFBP49765 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
VEGFBP49765 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
VEGFBP49765 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
VEGFBP49765 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
VEGFBP49765 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
VEGFBP49765 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VEGFBP49765 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VEGFBP49765 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VEGFBP49765 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VEGFBP49765 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
VEGFBP49765 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
VEGFBP49765 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VEGFBP49765 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
VEGFBP49765 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
VEGFBP49765 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
VEGFBP49765 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
VEGFBP49765 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VEGFBP49765 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VEGFBP49765 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VEGFBP49765 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VEGFBP49765 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
VEGFBP49765 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
VEGFBP49765 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
VEGFBP49765 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VEGFBP49765 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VEGFBP49765 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VEGFBP49765 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VEGFBP49765 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VEGFBP49765 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
VEGFBP49765 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
VEGFBP49765 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
VEGFBP49765 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
VEGFBP49765 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
VEGFBP49765 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VEGFBP49765 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VEGFBP49765 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VEGFBP49765 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
VEGFBP49765 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VEGFBP49765 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
VEGFBP49765 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VEGFBP49765 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
VEGFBP49765 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VEGFBP49765 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
VEGFBP49765 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VEGFBP49765 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VEGFBP49765 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VEGFBP49765 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VEGFBP49765 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VEGFBP49765 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
VEGFBP49765 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VEGFBP49765 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
VEGFBP49765 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
VEGFBP49765 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
VEGFBP49765 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VEGFBP49765 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VEGFBP49765 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
VEGFBP49765 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VEGFBP49765 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VEGFBP49765 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VEGFBP49765 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
VEGFBP49765 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VEGFBP49765 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VEGFBP49765 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VEGFBP49765 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VEGFBP49765 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VEGFBP49765 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
VEGFBP49765 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
VEGFBP49765 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
VEGFBP49765 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VEGFBP49765 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
VEGFBP49765 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VEGFBP49765 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VEGFBP49765 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VEGFBP49765 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VEGFBP49765 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
VEGFBP49765 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
VEGFBP49765 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
VEGFBP49765 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
VEGFBP49765 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
VEGFBP49765 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
VEGFBP49765 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
VEGFBP49765 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
VEGFBP49765 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VEGFBP49765 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VEGFBP49765 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VEGFBP49765 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VEGFBP49765 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
VEGFBP49765 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
VEGFBP49765 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
VEGFBP49765 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms