Protein–RNA interactions for Protein: P48507

GCLM, Glutamate--cysteine ligase regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLMP48507 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GCLMP48507 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GCLMP48507 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GCLMP48507 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GCLMP48507 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GCLMP48507 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GCLMP48507 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GCLMP48507 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GCLMP48507 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GCLMP48507 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GCLMP48507 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GCLMP48507 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GCLMP48507 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GCLMP48507 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GCLMP48507 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GCLMP48507 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GCLMP48507 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GCLMP48507 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GCLMP48507 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GCLMP48507 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GCLMP48507 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GCLMP48507 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GCLMP48507 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GCLMP48507 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GCLMP48507 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GCLMP48507 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
GCLMP48507 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
GCLMP48507 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GCLMP48507 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GCLMP48507 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GCLMP48507 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GCLMP48507 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GCLMP48507 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
GCLMP48507 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GCLMP48507 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GCLMP48507 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GCLMP48507 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GCLMP48507 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
GCLMP48507 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
GCLMP48507 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GCLMP48507 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GCLMP48507 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GCLMP48507 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GCLMP48507 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GCLMP48507 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GCLMP48507 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GCLMP48507 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GCLMP48507 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GCLMP48507 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
GCLMP48507 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GCLMP48507 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GCLMP48507 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GCLMP48507 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GCLMP48507 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GCLMP48507 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GCLMP48507 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GCLMP48507 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GCLMP48507 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GCLMP48507 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GCLMP48507 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GCLMP48507 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GCLMP48507 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GCLMP48507 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GCLMP48507 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GCLMP48507 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GCLMP48507 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GCLMP48507 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GCLMP48507 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GCLMP48507 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GCLMP48507 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GCLMP48507 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GCLMP48507 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GCLMP48507 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GCLMP48507 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GCLMP48507 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GCLMP48507 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GCLMP48507 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GCLMP48507 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GCLMP48507 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GCLMP48507 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GCLMP48507 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GCLMP48507 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GCLMP48507 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GCLMP48507 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GCLMP48507 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GCLMP48507 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
GCLMP48507 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GCLMP48507 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GCLMP48507 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GCLMP48507 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GCLMP48507 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GCLMP48507 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GCLMP48507 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GCLMP48507 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GCLMP48507 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GCLMP48507 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GCLMP48507 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GCLMP48507 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GCLMP48507 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GCLMP48507 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms