Protein–RNA interactions for Protein: P48058

GRIA4, Glutamate receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA4P48058 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRIA4P48058 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRIA4P48058 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRIA4P48058 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRIA4P48058 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRIA4P48058 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRIA4P48058 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRIA4P48058 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRIA4P48058 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRIA4P48058 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRIA4P48058 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
GRIA4P48058 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRIA4P48058 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRIA4P48058 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRIA4P48058 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRIA4P48058 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRIA4P48058 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRIA4P48058 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRIA4P48058 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRIA4P48058 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRIA4P48058 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRIA4P48058 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRIA4P48058 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRIA4P48058 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRIA4P48058 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRIA4P48058 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
GRIA4P48058 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRIA4P48058 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRIA4P48058 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRIA4P48058 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRIA4P48058 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRIA4P48058 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRIA4P48058 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRIA4P48058 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRIA4P48058 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRIA4P48058 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRIA4P48058 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRIA4P48058 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRIA4P48058 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GRIA4P48058 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GRIA4P48058 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GRIA4P48058 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GRIA4P48058 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GRIA4P48058 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GRIA4P48058 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GRIA4P48058 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GRIA4P48058 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
GRIA4P48058 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
GRIA4P48058 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GRIA4P48058 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GRIA4P48058 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GRIA4P48058 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
GRIA4P48058 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GRIA4P48058 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GRIA4P48058 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
GRIA4P48058 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GRIA4P48058 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GRIA4P48058 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GRIA4P48058 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GRIA4P48058 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GRIA4P48058 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GRIA4P48058 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GRIA4P48058 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GRIA4P48058 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GRIA4P48058 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GRIA4P48058 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GRIA4P48058 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GRIA4P48058 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GRIA4P48058 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GRIA4P48058 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GRIA4P48058 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GRIA4P48058 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GRIA4P48058 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GRIA4P48058 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GRIA4P48058 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GRIA4P48058 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GRIA4P48058 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GRIA4P48058 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GRIA4P48058 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GRIA4P48058 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GRIA4P48058 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GRIA4P48058 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GRIA4P48058 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GRIA4P48058 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GRIA4P48058 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GRIA4P48058 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GRIA4P48058 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GRIA4P48058 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GRIA4P48058 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GRIA4P48058 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GRIA4P48058 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GRIA4P48058 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GRIA4P48058 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GRIA4P48058 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GRIA4P48058 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GRIA4P48058 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GRIA4P48058 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GRIA4P48058 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GRIA4P48058 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GRIA4P48058 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms