Protein–RNA interactions for Protein: P46939

UTRN, Utrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTRNP46939 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
UTRNP46939 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
UTRNP46939 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
UTRNP46939 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
UTRNP46939 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
UTRNP46939 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
UTRNP46939 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
UTRNP46939 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
UTRNP46939 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
UTRNP46939 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
UTRNP46939 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
UTRNP46939 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
UTRNP46939 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
UTRNP46939 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
UTRNP46939 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
UTRNP46939 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
UTRNP46939 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
UTRNP46939 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
UTRNP46939 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
UTRNP46939 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
UTRNP46939 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
UTRNP46939 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
UTRNP46939 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
UTRNP46939 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
UTRNP46939 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
UTRNP46939 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
UTRNP46939 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
UTRNP46939 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
UTRNP46939 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
UTRNP46939 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
UTRNP46939 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
UTRNP46939 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
UTRNP46939 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
UTRNP46939 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
UTRNP46939 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
UTRNP46939 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
UTRNP46939 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
UTRNP46939 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
UTRNP46939 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
UTRNP46939 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
UTRNP46939 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
UTRNP46939 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
UTRNP46939 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
UTRNP46939 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
UTRNP46939 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
UTRNP46939 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
UTRNP46939 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
UTRNP46939 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
UTRNP46939 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
UTRNP46939 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
UTRNP46939 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
UTRNP46939 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
UTRNP46939 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
UTRNP46939 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
UTRNP46939 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
UTRNP46939 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
UTRNP46939 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
UTRNP46939 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
UTRNP46939 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
UTRNP46939 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
UTRNP46939 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
UTRNP46939 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
UTRNP46939 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
UTRNP46939 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
UTRNP46939 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
UTRNP46939 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
UTRNP46939 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
UTRNP46939 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
UTRNP46939 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
UTRNP46939 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
UTRNP46939 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
UTRNP46939 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
UTRNP46939 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
UTRNP46939 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
UTRNP46939 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
UTRNP46939 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
UTRNP46939 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
UTRNP46939 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
UTRNP46939 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
UTRNP46939 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
UTRNP46939 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
UTRNP46939 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
UTRNP46939 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
UTRNP46939 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
UTRNP46939 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
UTRNP46939 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
UTRNP46939 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
UTRNP46939 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
UTRNP46939 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
UTRNP46939 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
UTRNP46939 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
UTRNP46939 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
UTRNP46939 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
UTRNP46939 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
UTRNP46939 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
UTRNP46939 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
UTRNP46939 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
UTRNP46939 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
UTRNP46939 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
UTRNP46939 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms