Protein–RNA interactions for Protein: P45378

TNNT3, Troponin T, fast skeletal muscle, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT3P45378 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNNT3P45378 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNNT3P45378 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNNT3P45378 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNNT3P45378 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNNT3P45378 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNNT3P45378 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNNT3P45378 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNNT3P45378 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNNT3P45378 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNNT3P45378 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNNT3P45378 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNNT3P45378 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNNT3P45378 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNNT3P45378 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNNT3P45378 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNNT3P45378 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNNT3P45378 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNNT3P45378 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNNT3P45378 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNNT3P45378 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNNT3P45378 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNNT3P45378 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNNT3P45378 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNNT3P45378 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TNNT3P45378 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNNT3P45378 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TNNT3P45378 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TNNT3P45378 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TNNT3P45378 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNNT3P45378 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNNT3P45378 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNNT3P45378 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNNT3P45378 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNNT3P45378 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNNT3P45378 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNNT3P45378 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNNT3P45378 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNNT3P45378 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNNT3P45378 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNNT3P45378 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TNNT3P45378 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNNT3P45378 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNNT3P45378 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNNT3P45378 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNNT3P45378 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNNT3P45378 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNNT3P45378 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNNT3P45378 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNNT3P45378 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNNT3P45378 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNNT3P45378 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNNT3P45378 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNNT3P45378 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNNT3P45378 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNNT3P45378 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNNT3P45378 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNNT3P45378 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNNT3P45378 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNNT3P45378 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNNT3P45378 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNNT3P45378 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNNT3P45378 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNNT3P45378 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNNT3P45378 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNNT3P45378 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNNT3P45378 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNNT3P45378 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNNT3P45378 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNNT3P45378 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNNT3P45378 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNNT3P45378 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNNT3P45378 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNNT3P45378 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNNT3P45378 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNNT3P45378 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNNT3P45378 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNNT3P45378 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNNT3P45378 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNNT3P45378 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNNT3P45378 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNNT3P45378 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNNT3P45378 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNNT3P45378 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNNT3P45378 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNNT3P45378 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNNT3P45378 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNNT3P45378 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNNT3P45378 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNNT3P45378 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNNT3P45378 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNNT3P45378 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNNT3P45378 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNNT3P45378 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNNT3P45378 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNNT3P45378 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNNT3P45378 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNNT3P45378 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNNT3P45378 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNNT3P45378 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms