Protein–RNA interactions for Protein: P40425

PBX2, Pre-B-cell leukemia transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX2P40425 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PBX2P40425 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PBX2P40425 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PBX2P40425 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PBX2P40425 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PBX2P40425 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PBX2P40425 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PBX2P40425 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PBX2P40425 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PBX2P40425 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PBX2P40425 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PBX2P40425 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PBX2P40425 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PBX2P40425 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PBX2P40425 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PBX2P40425 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PBX2P40425 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PBX2P40425 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PBX2P40425 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PBX2P40425 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PBX2P40425 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PBX2P40425 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PBX2P40425 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PBX2P40425 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PBX2P40425 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PBX2P40425 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PBX2P40425 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PBX2P40425 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PBX2P40425 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PBX2P40425 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PBX2P40425 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PBX2P40425 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PBX2P40425 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PBX2P40425 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PBX2P40425 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PBX2P40425 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PBX2P40425 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PBX2P40425 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PBX2P40425 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PBX2P40425 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PBX2P40425 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PBX2P40425 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PBX2P40425 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PBX2P40425 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PBX2P40425 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PBX2P40425 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PBX2P40425 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PBX2P40425 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PBX2P40425 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PBX2P40425 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PBX2P40425 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PBX2P40425 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PBX2P40425 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PBX2P40425 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PBX2P40425 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PBX2P40425 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PBX2P40425 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PBX2P40425 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PBX2P40425 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PBX2P40425 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PBX2P40425 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PBX2P40425 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PBX2P40425 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PBX2P40425 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PBX2P40425 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PBX2P40425 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PBX2P40425 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PBX2P40425 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PBX2P40425 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PBX2P40425 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PBX2P40425 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PBX2P40425 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PBX2P40425 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PBX2P40425 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PBX2P40425 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PBX2P40425 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PBX2P40425 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PBX2P40425 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PBX2P40425 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PBX2P40425 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PBX2P40425 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PBX2P40425 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PBX2P40425 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PBX2P40425 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PBX2P40425 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PBX2P40425 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PBX2P40425 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PBX2P40425 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PBX2P40425 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PBX2P40425 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PBX2P40425 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PBX2P40425 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PBX2P40425 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PBX2P40425 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PBX2P40425 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PBX2P40425 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PBX2P40425 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PBX2P40425 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PBX2P40425 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PBX2P40425 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms