Protein–RNA interactions for Protein: P39927

PTI1, Protein PTI1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PTI1P39927 GIM5YML094W 492 nt2.63□□□□□ -1.99
PTI1P39927 snR43snR43 209 nt2.63□□□□□ -1.99
PTI1P39927 RAX2YLR084C 3663 nt2.63□□□□□ -1.99
PTI1P39927 YLR001CYLR001C 2589 nt2.63□□□□□ -1.99
PTI1P39927 PDR3YBL005W 2931 nt2.63□□□□□ -1.99
PTI1P39927 PEX5YDR244W 1839 nt2.63□□□□□ -1.99
PTI1P39927 VBA4YDR119W 2307 nt2.63□□□□□ -1.99
PTI1P39927 SAP1YER047C 2694 nt2.63□□□□□ -1.99
PTI1P39927 MUB1YMR100W 1863 nt2.62□□□□□ -1.99
PTI1P39927 NSA1YGL111W 1392 nt2.62□□□□□ -1.99
PTI1P39927 SEC7YDR170C 6030 nt2.62□□□□□ -1.99
PTI1P39927 STP2YHR006W 1626 nt2.62□□□□□ -1.99
PTI1P39927 YER165C-AYER165C-A 357 nt2.62□□□□□ -1.99
PTI1P39927 SAE2YGL175C 1038 nt2.62□□□□□ -1.99
PTI1P39927 PRP38YGR075C 729 nt2.62□□□□□ -1.99
PTI1P39927 DSE2YHR143W 978 nt2.62□□□□□ -1.99
PTI1P39927 REC102YLR329W 795 nt2.62□□□□□ -1.99
PTI1P39927 DYN3YMR299C 939 nt2.62□□□□□ -1.99
PTI1P39927 GRE2YOL151W 1029 nt2.62□□□□□ -1.99
PTI1P39927 YPL119C-AYPL119C-A 264 nt2.62□□□□□ -1.99
PTI1P39927 YGR067CYGR067C 2415 nt2.62□□□□□ -1.99
PTI1P39927 MSH2YOL090W 2895 nt2.62□□□□□ -1.99
PTI1P39927 CWH41YGL027C 2502 nt2.62□□□□□ -1.99
PTI1P39927 YCG1YDR325W 3108 nt2.62□□□□□ -1.99
PTI1P39927 AVT5YBL089W 1380 nt2.61□□□□□ -1.99
PTI1P39927 MSH4YFL003C 2637 nt2.61□□□□□ -1.99
PTI1P39927 RSM28YDR494W 1086 nt2.61□□□□□ -1.99
PTI1P39927 SNO3YFL060C 669 nt2.61□□□□□ -1.99
PTI1P39927 YIP1YGR172C 747 nt2.61□□□□□ -1.99
PTI1P39927 RPS21BYJL136C 264 nt2.61□□□□□ -1.99
PTI1P39927 CSI1YMR025W 888 nt2.61□□□□□ -1.99
PTI1P39927 PAI3YMR174C 207 nt2.61□□□□□ -1.99
PTI1P39927 SNO2YNL334C 669 nt2.61□□□□□ -1.99
PTI1P39927 YPL276WYPL276W 438 nt2.61□□□□□ -1.99
PTI1P39927 RIM13YMR154C 2184 nt2.61□□□□□ -1.99
PTI1P39927 ECM21YBL101C 3354 nt2.61□□□□□ -1.99
PTI1P39927 LCB4YOR171C 1875 nt2.6□□□□□ -1.99
PTI1P39927 MYO5YMR109W 3660 nt2.6□□□□□ -1.99
PTI1P39927 MVB12YGR206W 306 nt2.6□□□□□ -1.99
PTI1P39927 YLR271WYLR271W 825 nt2.6□□□□□ -1.99
PTI1P39927 SMA2YML066C 1110 nt2.6□□□□□ -1.99
PTI1P39927 RPL23AYBL087C 414 nt2.6□□□□□ -1.99
PTI1P39927 YOR385WYOR385W 873 nt2.6□□□□□ -1.99
PTI1P39927 SUS1YBR111W-A 291 nt2.6□□□□□ -1.99
PTI1P39927 ADF1YCL058W-A 342 nt2.6□□□□□ -1.99
PTI1P39927 PEX6YNL329C 3093 nt2.6□□□□□ -1.99
PTI1P39927 YFL002W-BYFL002W-B 1317 nt2.6□□□□□ -1.99
PTI1P39927 YGR161W-AYGR161W-A 1317 nt2.6□□□□□ -1.99
PTI1P39927 YBL100W-AYBL100W-A 1317 nt2.6□□□□□ -1.99
PTI1P39927 YCL020WYCL020W 1317 nt2.6□□□□□ -1.99
PTI1P39927 NMA111YNL123W 2994 nt2.59□□□□□ -1.99
PTI1P39927 GYL1YMR192W 2163 nt2.59□□□□□ -1.99
PTI1P39927 FKS3YMR306W 5358 nt2.59□□□□□ -1.99
PTI1P39927 HLR1YDR528W 1272 nt2.59□□□□□ -1.99
PTI1P39927 RSM18YER050C 417 nt2.59□□□□□ -1.99
PTI1P39927 MST27YGL051W 705 nt2.59□□□□□ -1.99
PTI1P39927 YHR050W-AYHR050W-A 171 nt2.59□□□□□ -1.99
PTI1P39927 YKR011CYKR011C 1062 nt2.59□□□□□ -1.99
PTI1P39927 MST28YAR033W 705 nt2.59□□□□□ -1.99
PTI1P39927 RPL6AYML073C 531 nt2.59□□□□□ -1.99
PTI1P39927 PFY1YOR122C 381 nt2.59□□□□□ -1.99
PTI1P39927 YPL039WYPL039W 951 nt2.59□□□□□ -1.99
PTI1P39927 YRO2YBR054W 1035 nt2.59□□□□□ -1.99
PTI1P39927 YPR147CYPR147C 915 nt2.59□□□□□ -1.99
PTI1P39927 YPR153WYPR153W 423 nt2.59□□□□□ -1.99
PTI1P39927 YDR061WYDR061W 1620 nt2.59□□□□□ -1.99
PTI1P39927 MNT3YIL014W 1893 nt2.58□□□□□ -2
PTI1P39927 REG1YDR028C 3045 nt2.58□□□□□ -2
PTI1P39927 CHS3YBR023C 3498 nt2.58□□□□□ -2
PTI1P39927 YCR013CYCR013C 648 nt2.58□□□□□ -2
PTI1P39927 snR5snR5 204 nt2.58□□□□□ -2
PTI1P39927 YDR262WYDR262W 819 nt2.58□□□□□ -2
PTI1P39927 ERP6YGL002W 651 nt2.58□□□□□ -2
PTI1P39927 RPB9YGL070C 369 nt2.58□□□□□ -2
PTI1P39927 YIP5YGL161C 933 nt2.58□□□□□ -2
PTI1P39927 MND1YGL183C 660 nt2.58□□□□□ -2
PTI1P39927 RPS23AYGR118W 438 nt2.58□□□□□ -2
PTI1P39927 EFG1YGR271C-A 702 nt2.58□□□□□ -2
PTI1P39927 RPL27AYHR010W 411 nt2.58□□□□□ -2
PTI1P39927 YIL046W-AYIL046W-A 165 nt2.58□□□□□ -2
PTI1P39927 PRP21YJL203W 843 nt2.58□□□□□ -2
PTI1P39927 YMR141CYMR141C 309 nt2.58□□□□□ -2
PTI1P39927 HHF2YNL030W 312 nt2.58□□□□□ -2
PTI1P39927 RSM19YNR037C 276 nt2.58□□□□□ -2
PTI1P39927 LCL1YPL056C 306 nt2.58□□□□□ -2
PTI1P39927 RPS23BYPR132W 438 nt2.58□□□□□ -2
PTI1P39927 CUR1YPR158W 759 nt2.58□□□□□ -2
PTI1P39927 LST4YKL176C 2487 nt2.58□□□□□ -2
PTI1P39927 YDR034C-DYDR034C-D 5313 nt2.57□□□□□ -2
PTI1P39927 SLK19YOR195W 2466 nt2.57□□□□□ -2
PTI1P39927 PBP4YDL053C 558 nt2.57□□□□□ -2
PTI1P39927 CKA1YIL035C 1119 nt2.57□□□□□ -2
PTI1P39927 tW(CCA)G1tW(CCA)G1 72 nt2.57□□□□□ -2
PTI1P39927 tW(CCA)G2tW(CCA)G2 72 nt2.57□□□□□ -2
PTI1P39927 tW(CCA)JtW(CCA)J 72 nt2.57□□□□□ -2
PTI1P39927 tW(CCA)KtW(CCA)K 72 nt2.57□□□□□ -2
PTI1P39927 tW(CCA)MtW(CCA)M 72 nt2.57□□□□□ -2
PTI1P39927 tW(CCA)PtW(CCA)P 72 nt2.57□□□□□ -2
PTI1P39927 RPS22AYJL190C 393 nt2.57□□□□□ -2
PTI1P39927 TUM1YOR251C 915 nt2.57□□□□□ -2
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 18.8 ms