Protein–RNA interactions for Protein: P38919

EIF4A3, Eukaryotic initiation factor 4A-III, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4A3P38919 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EIF4A3P38919 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EIF4A3P38919 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EIF4A3P38919 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EIF4A3P38919 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EIF4A3P38919 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EIF4A3P38919 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EIF4A3P38919 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EIF4A3P38919 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EIF4A3P38919 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EIF4A3P38919 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EIF4A3P38919 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EIF4A3P38919 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EIF4A3P38919 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EIF4A3P38919 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EIF4A3P38919 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EIF4A3P38919 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EIF4A3P38919 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EIF4A3P38919 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EIF4A3P38919 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EIF4A3P38919 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EIF4A3P38919 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EIF4A3P38919 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EIF4A3P38919 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EIF4A3P38919 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
EIF4A3P38919 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EIF4A3P38919 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EIF4A3P38919 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EIF4A3P38919 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EIF4A3P38919 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
EIF4A3P38919 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EIF4A3P38919 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EIF4A3P38919 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EIF4A3P38919 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EIF4A3P38919 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EIF4A3P38919 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EIF4A3P38919 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EIF4A3P38919 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EIF4A3P38919 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EIF4A3P38919 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EIF4A3P38919 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EIF4A3P38919 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EIF4A3P38919 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EIF4A3P38919 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
EIF4A3P38919 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
EIF4A3P38919 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
EIF4A3P38919 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
EIF4A3P38919 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
EIF4A3P38919 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
EIF4A3P38919 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
EIF4A3P38919 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EIF4A3P38919 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EIF4A3P38919 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EIF4A3P38919 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EIF4A3P38919 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EIF4A3P38919 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EIF4A3P38919 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EIF4A3P38919 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EIF4A3P38919 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
EIF4A3P38919 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EIF4A3P38919 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EIF4A3P38919 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EIF4A3P38919 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EIF4A3P38919 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EIF4A3P38919 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EIF4A3P38919 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EIF4A3P38919 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EIF4A3P38919 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EIF4A3P38919 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EIF4A3P38919 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EIF4A3P38919 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EIF4A3P38919 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EIF4A3P38919 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EIF4A3P38919 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EIF4A3P38919 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EIF4A3P38919 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EIF4A3P38919 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EIF4A3P38919 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EIF4A3P38919 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
EIF4A3P38919 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
EIF4A3P38919 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EIF4A3P38919 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
EIF4A3P38919 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EIF4A3P38919 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EIF4A3P38919 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EIF4A3P38919 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EIF4A3P38919 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EIF4A3P38919 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EIF4A3P38919 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EIF4A3P38919 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EIF4A3P38919 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EIF4A3P38919 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
EIF4A3P38919 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EIF4A3P38919 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EIF4A3P38919 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EIF4A3P38919 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EIF4A3P38919 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EIF4A3P38919 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EIF4A3P38919 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EIF4A3P38919 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms