Protein–RNA interactions for Protein: P34932

HSPA4, Heat shock 70 kDa protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 840 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPA4P34932 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HSPA4P34932 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HSPA4P34932 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HSPA4P34932 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HSPA4P34932 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HSPA4P34932 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HSPA4P34932 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HSPA4P34932 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HSPA4P34932 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HSPA4P34932 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
HSPA4P34932 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HSPA4P34932 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
HSPA4P34932 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HSPA4P34932 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HSPA4P34932 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HSPA4P34932 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HSPA4P34932 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HSPA4P34932 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HSPA4P34932 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HSPA4P34932 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HSPA4P34932 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HSPA4P34932 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HSPA4P34932 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HSPA4P34932 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HSPA4P34932 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HSPA4P34932 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HSPA4P34932 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HSPA4P34932 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HSPA4P34932 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HSPA4P34932 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HSPA4P34932 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
HSPA4P34932 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HSPA4P34932 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HSPA4P34932 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HSPA4P34932 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HSPA4P34932 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
HSPA4P34932 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
HSPA4P34932 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HSPA4P34932 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HSPA4P34932 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HSPA4P34932 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
HSPA4P34932 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
HSPA4P34932 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
HSPA4P34932 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
HSPA4P34932 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
HSPA4P34932 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
HSPA4P34932 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HSPA4P34932 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HSPA4P34932 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HSPA4P34932 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HSPA4P34932 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HSPA4P34932 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HSPA4P34932 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HSPA4P34932 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HSPA4P34932 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HSPA4P34932 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HSPA4P34932 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HSPA4P34932 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HSPA4P34932 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HSPA4P34932 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HSPA4P34932 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HSPA4P34932 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
HSPA4P34932 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HSPA4P34932 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HSPA4P34932 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HSPA4P34932 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HSPA4P34932 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HSPA4P34932 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HSPA4P34932 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HSPA4P34932 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HSPA4P34932 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HSPA4P34932 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HSPA4P34932 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HSPA4P34932 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HSPA4P34932 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HSPA4P34932 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HSPA4P34932 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HSPA4P34932 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HSPA4P34932 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HSPA4P34932 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
HSPA4P34932 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HSPA4P34932 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HSPA4P34932 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HSPA4P34932 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HSPA4P34932 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HSPA4P34932 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HSPA4P34932 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HSPA4P34932 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HSPA4P34932 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HSPA4P34932 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
HSPA4P34932 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HSPA4P34932 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HSPA4P34932 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HSPA4P34932 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HSPA4P34932 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HSPA4P34932 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HSPA4P34932 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HSPA4P34932 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HSPA4P34932 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HSPA4P34932 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms