Protein–RNA interactions for Protein: P32455

GBP1, Guanylate-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP1P32455 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GBP1P32455 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GBP1P32455 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GBP1P32455 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GBP1P32455 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GBP1P32455 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GBP1P32455 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GBP1P32455 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GBP1P32455 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GBP1P32455 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GBP1P32455 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GBP1P32455 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GBP1P32455 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GBP1P32455 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GBP1P32455 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GBP1P32455 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GBP1P32455 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GBP1P32455 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GBP1P32455 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GBP1P32455 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GBP1P32455 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GBP1P32455 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GBP1P32455 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GBP1P32455 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GBP1P32455 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GBP1P32455 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GBP1P32455 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
GBP1P32455 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GBP1P32455 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GBP1P32455 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GBP1P32455 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GBP1P32455 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GBP1P32455 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GBP1P32455 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GBP1P32455 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GBP1P32455 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GBP1P32455 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GBP1P32455 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GBP1P32455 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GBP1P32455 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GBP1P32455 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GBP1P32455 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GBP1P32455 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GBP1P32455 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GBP1P32455 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GBP1P32455 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GBP1P32455 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GBP1P32455 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GBP1P32455 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GBP1P32455 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GBP1P32455 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GBP1P32455 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GBP1P32455 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GBP1P32455 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GBP1P32455 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GBP1P32455 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GBP1P32455 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GBP1P32455 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GBP1P32455 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GBP1P32455 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GBP1P32455 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GBP1P32455 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GBP1P32455 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
GBP1P32455 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GBP1P32455 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GBP1P32455 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GBP1P32455 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GBP1P32455 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
GBP1P32455 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GBP1P32455 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GBP1P32455 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GBP1P32455 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GBP1P32455 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GBP1P32455 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GBP1P32455 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GBP1P32455 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GBP1P32455 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GBP1P32455 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GBP1P32455 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GBP1P32455 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GBP1P32455 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GBP1P32455 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GBP1P32455 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GBP1P32455 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GBP1P32455 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GBP1P32455 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GBP1P32455 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GBP1P32455 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GBP1P32455 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GBP1P32455 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GBP1P32455 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GBP1P32455 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GBP1P32455 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GBP1P32455 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GBP1P32455 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GBP1P32455 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GBP1P32455 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GBP1P32455 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GBP1P32455 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GBP1P32455 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms