Protein–RNA interactions for Protein: P28290

SSFA2, Sperm-specific antigen 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSFA2P28290 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
SSFA2P28290 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SSFA2P28290 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SSFA2P28290 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SSFA2P28290 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SSFA2P28290 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
SSFA2P28290 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
SSFA2P28290 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SSFA2P28290 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SSFA2P28290 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
SSFA2P28290 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SSFA2P28290 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
SSFA2P28290 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SSFA2P28290 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SSFA2P28290 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SSFA2P28290 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SSFA2P28290 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SSFA2P28290 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SSFA2P28290 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SSFA2P28290 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SSFA2P28290 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SSFA2P28290 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SSFA2P28290 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SSFA2P28290 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SSFA2P28290 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SSFA2P28290 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SSFA2P28290 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SSFA2P28290 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SSFA2P28290 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SSFA2P28290 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SSFA2P28290 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SSFA2P28290 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SSFA2P28290 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SSFA2P28290 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SSFA2P28290 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SSFA2P28290 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SSFA2P28290 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
SSFA2P28290 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SSFA2P28290 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SSFA2P28290 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SSFA2P28290 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SSFA2P28290 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SSFA2P28290 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SSFA2P28290 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SSFA2P28290 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SSFA2P28290 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
SSFA2P28290 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SSFA2P28290 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SSFA2P28290 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SSFA2P28290 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SSFA2P28290 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SSFA2P28290 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SSFA2P28290 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SSFA2P28290 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SSFA2P28290 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SSFA2P28290 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SSFA2P28290 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SSFA2P28290 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SSFA2P28290 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SSFA2P28290 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SSFA2P28290 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SSFA2P28290 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SSFA2P28290 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SSFA2P28290 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SSFA2P28290 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SSFA2P28290 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
SSFA2P28290 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SSFA2P28290 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
SSFA2P28290 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SSFA2P28290 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SSFA2P28290 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SSFA2P28290 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SSFA2P28290 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SSFA2P28290 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SSFA2P28290 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
SSFA2P28290 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SSFA2P28290 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SSFA2P28290 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SSFA2P28290 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SSFA2P28290 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SSFA2P28290 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SSFA2P28290 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SSFA2P28290 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
SSFA2P28290 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SSFA2P28290 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SSFA2P28290 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SSFA2P28290 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SSFA2P28290 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SSFA2P28290 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SSFA2P28290 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SSFA2P28290 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SSFA2P28290 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SSFA2P28290 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SSFA2P28290 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SSFA2P28290 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SSFA2P28290 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SSFA2P28290 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SSFA2P28290 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
SSFA2P28290 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SSFA2P28290 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms