Protein–RNA interactions for Protein: P26022

PTX3, Pentraxin-related protein PTX3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX3P26022 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTX3P26022 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTX3P26022 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTX3P26022 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTX3P26022 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTX3P26022 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTX3P26022 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTX3P26022 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTX3P26022 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTX3P26022 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTX3P26022 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTX3P26022 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTX3P26022 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTX3P26022 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTX3P26022 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTX3P26022 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
PTX3P26022 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTX3P26022 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
PTX3P26022 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTX3P26022 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTX3P26022 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTX3P26022 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTX3P26022 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTX3P26022 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTX3P26022 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTX3P26022 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTX3P26022 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTX3P26022 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTX3P26022 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTX3P26022 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTX3P26022 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTX3P26022 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTX3P26022 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTX3P26022 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTX3P26022 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTX3P26022 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTX3P26022 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTX3P26022 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTX3P26022 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTX3P26022 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
PTX3P26022 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTX3P26022 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTX3P26022 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTX3P26022 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTX3P26022 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTX3P26022 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTX3P26022 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTX3P26022 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTX3P26022 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTX3P26022 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTX3P26022 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTX3P26022 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTX3P26022 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
PTX3P26022 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTX3P26022 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTX3P26022 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTX3P26022 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTX3P26022 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTX3P26022 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTX3P26022 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTX3P26022 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTX3P26022 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTX3P26022 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTX3P26022 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTX3P26022 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTX3P26022 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTX3P26022 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTX3P26022 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTX3P26022 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTX3P26022 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTX3P26022 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
PTX3P26022 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTX3P26022 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTX3P26022 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTX3P26022 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTX3P26022 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTX3P26022 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTX3P26022 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTX3P26022 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTX3P26022 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTX3P26022 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTX3P26022 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTX3P26022 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTX3P26022 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTX3P26022 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTX3P26022 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTX3P26022 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTX3P26022 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTX3P26022 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTX3P26022 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTX3P26022 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTX3P26022 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTX3P26022 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTX3P26022 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTX3P26022 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTX3P26022 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
PTX3P26022 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
PTX3P26022 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTX3P26022 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTX3P26022 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms