Protein–RNA interactions for Protein: P25791

LMO2, Rhombotin-2, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO2P25791 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LMO2P25791 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LMO2P25791 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LMO2P25791 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LMO2P25791 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
LMO2P25791 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LMO2P25791 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LMO2P25791 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LMO2P25791 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LMO2P25791 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LMO2P25791 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LMO2P25791 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LMO2P25791 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LMO2P25791 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LMO2P25791 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LMO2P25791 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LMO2P25791 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LMO2P25791 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LMO2P25791 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
LMO2P25791 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LMO2P25791 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LMO2P25791 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LMO2P25791 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LMO2P25791 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LMO2P25791 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LMO2P25791 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LMO2P25791 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LMO2P25791 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LMO2P25791 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LMO2P25791 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LMO2P25791 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LMO2P25791 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LMO2P25791 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LMO2P25791 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LMO2P25791 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LMO2P25791 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LMO2P25791 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LMO2P25791 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LMO2P25791 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LMO2P25791 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
LMO2P25791 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LMO2P25791 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LMO2P25791 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LMO2P25791 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMO2P25791 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMO2P25791 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMO2P25791 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMO2P25791 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMO2P25791 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMO2P25791 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMO2P25791 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LMO2P25791 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMO2P25791 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMO2P25791 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMO2P25791 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMO2P25791 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LMO2P25791 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LMO2P25791 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LMO2P25791 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LMO2P25791 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LMO2P25791 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LMO2P25791 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LMO2P25791 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LMO2P25791 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
LMO2P25791 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
LMO2P25791 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LMO2P25791 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LMO2P25791 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LMO2P25791 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LMO2P25791 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LMO2P25791 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LMO2P25791 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LMO2P25791 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LMO2P25791 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LMO2P25791 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LMO2P25791 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LMO2P25791 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LMO2P25791 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LMO2P25791 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LMO2P25791 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LMO2P25791 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LMO2P25791 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
LMO2P25791 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LMO2P25791 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LMO2P25791 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LMO2P25791 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LMO2P25791 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LMO2P25791 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LMO2P25791 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LMO2P25791 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LMO2P25791 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LMO2P25791 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LMO2P25791 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LMO2P25791 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LMO2P25791 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LMO2P25791 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LMO2P25791 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LMO2P25791 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LMO2P25791 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LMO2P25791 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms