Protein–RNA interactions for Protein: P23634

ATP2B4, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B4P23634 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ATP2B4P23634 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATP2B4P23634 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATP2B4P23634 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATP2B4P23634 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATP2B4P23634 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATP2B4P23634 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATP2B4P23634 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATP2B4P23634 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATP2B4P23634 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATP2B4P23634 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATP2B4P23634 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATP2B4P23634 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATP2B4P23634 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATP2B4P23634 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATP2B4P23634 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATP2B4P23634 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATP2B4P23634 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATP2B4P23634 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
ATP2B4P23634 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATP2B4P23634 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATP2B4P23634 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATP2B4P23634 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATP2B4P23634 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATP2B4P23634 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATP2B4P23634 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATP2B4P23634 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATP2B4P23634 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATP2B4P23634 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATP2B4P23634 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATP2B4P23634 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATP2B4P23634 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATP2B4P23634 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATP2B4P23634 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATP2B4P23634 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATP2B4P23634 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATP2B4P23634 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
ATP2B4P23634 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATP2B4P23634 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATP2B4P23634 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATP2B4P23634 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATP2B4P23634 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATP2B4P23634 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATP2B4P23634 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATP2B4P23634 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATP2B4P23634 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
ATP2B4P23634 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATP2B4P23634 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATP2B4P23634 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATP2B4P23634 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATP2B4P23634 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATP2B4P23634 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATP2B4P23634 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
ATP2B4P23634 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATP2B4P23634 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATP2B4P23634 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
ATP2B4P23634 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATP2B4P23634 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATP2B4P23634 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATP2B4P23634 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATP2B4P23634 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATP2B4P23634 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATP2B4P23634 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATP2B4P23634 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATP2B4P23634 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATP2B4P23634 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATP2B4P23634 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATP2B4P23634 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATP2B4P23634 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
ATP2B4P23634 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATP2B4P23634 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATP2B4P23634 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATP2B4P23634 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATP2B4P23634 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP2B4P23634 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP2B4P23634 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP2B4P23634 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP2B4P23634 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP2B4P23634 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP2B4P23634 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP2B4P23634 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP2B4P23634 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP2B4P23634 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP2B4P23634 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP2B4P23634 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP2B4P23634 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP2B4P23634 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP2B4P23634 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP2B4P23634 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP2B4P23634 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP2B4P23634 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATP2B4P23634 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATP2B4P23634 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATP2B4P23634 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATP2B4P23634 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATP2B4P23634 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATP2B4P23634 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATP2B4P23634 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATP2B4P23634 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
ATP2B4P23634 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms