Protein–RNA interactions for Protein: P22607

FGFR3, Fibroblast growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR3P22607 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FGFR3P22607 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FGFR3P22607 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FGFR3P22607 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FGFR3P22607 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FGFR3P22607 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FGFR3P22607 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FGFR3P22607 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
FGFR3P22607 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FGFR3P22607 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FGFR3P22607 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
FGFR3P22607 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FGFR3P22607 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FGFR3P22607 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FGFR3P22607 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FGFR3P22607 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FGFR3P22607 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FGFR3P22607 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FGFR3P22607 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
FGFR3P22607 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FGFR3P22607 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FGFR3P22607 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FGFR3P22607 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FGFR3P22607 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FGFR3P22607 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
FGFR3P22607 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
FGFR3P22607 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FGFR3P22607 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FGFR3P22607 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FGFR3P22607 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
FGFR3P22607 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FGFR3P22607 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FGFR3P22607 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FGFR3P22607 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FGFR3P22607 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
FGFR3P22607 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FGFR3P22607 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FGFR3P22607 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FGFR3P22607 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
FGFR3P22607 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FGFR3P22607 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FGFR3P22607 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FGFR3P22607 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FGFR3P22607 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FGFR3P22607 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FGFR3P22607 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FGFR3P22607 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FGFR3P22607 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FGFR3P22607 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FGFR3P22607 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
FGFR3P22607 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FGFR3P22607 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FGFR3P22607 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FGFR3P22607 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FGFR3P22607 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FGFR3P22607 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FGFR3P22607 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FGFR3P22607 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FGFR3P22607 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FGFR3P22607 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FGFR3P22607 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FGFR3P22607 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FGFR3P22607 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FGFR3P22607 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FGFR3P22607 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FGFR3P22607 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FGFR3P22607 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FGFR3P22607 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FGFR3P22607 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FGFR3P22607 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FGFR3P22607 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
FGFR3P22607 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FGFR3P22607 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FGFR3P22607 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
FGFR3P22607 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FGFR3P22607 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
FGFR3P22607 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FGFR3P22607 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FGFR3P22607 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FGFR3P22607 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FGFR3P22607 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FGFR3P22607 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FGFR3P22607 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FGFR3P22607 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FGFR3P22607 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FGFR3P22607 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FGFR3P22607 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FGFR3P22607 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FGFR3P22607 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FGFR3P22607 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FGFR3P22607 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FGFR3P22607 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FGFR3P22607 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FGFR3P22607 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FGFR3P22607 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
FGFR3P22607 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FGFR3P22607 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FGFR3P22607 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FGFR3P22607 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FGFR3P22607 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms