Protein–RNA interactions for Protein: P21675

TAF1, Transcription initiation factor TFIID subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,872 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1P21675 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TAF1P21675 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TAF1P21675 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TAF1P21675 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TAF1P21675 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TAF1P21675 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TAF1P21675 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TAF1P21675 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TAF1P21675 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TAF1P21675 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TAF1P21675 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TAF1P21675 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TAF1P21675 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TAF1P21675 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TAF1P21675 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TAF1P21675 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TAF1P21675 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TAF1P21675 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TAF1P21675 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TAF1P21675 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TAF1P21675 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TAF1P21675 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TAF1P21675 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TAF1P21675 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TAF1P21675 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TAF1P21675 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TAF1P21675 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TAF1P21675 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
TAF1P21675 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TAF1P21675 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TAF1P21675 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TAF1P21675 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TAF1P21675 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TAF1P21675 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TAF1P21675 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TAF1P21675 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TAF1P21675 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TAF1P21675 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TAF1P21675 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TAF1P21675 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TAF1P21675 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TAF1P21675 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TAF1P21675 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
TAF1P21675 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TAF1P21675 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TAF1P21675 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TAF1P21675 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TAF1P21675 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TAF1P21675 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TAF1P21675 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TAF1P21675 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TAF1P21675 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TAF1P21675 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TAF1P21675 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TAF1P21675 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TAF1P21675 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TAF1P21675 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
TAF1P21675 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TAF1P21675 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TAF1P21675 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TAF1P21675 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TAF1P21675 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
TAF1P21675 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TAF1P21675 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TAF1P21675 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TAF1P21675 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TAF1P21675 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TAF1P21675 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
TAF1P21675 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TAF1P21675 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TAF1P21675 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TAF1P21675 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TAF1P21675 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TAF1P21675 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TAF1P21675 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TAF1P21675 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TAF1P21675 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TAF1P21675 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TAF1P21675 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TAF1P21675 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TAF1P21675 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TAF1P21675 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
TAF1P21675 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TAF1P21675 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TAF1P21675 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TAF1P21675 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TAF1P21675 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TAF1P21675 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TAF1P21675 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TAF1P21675 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TAF1P21675 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TAF1P21675 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TAF1P21675 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TAF1P21675 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TAF1P21675 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TAF1P21675 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.69
TAF1P21675 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.69
TAF1P21675 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
TAF1P21675 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
TAF1P21675 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms