Protein–RNA interactions for Protein: P21399

ACO1, Cytoplasmic aconitate hydratase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 889 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACO1P21399 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACO1P21399 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACO1P21399 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACO1P21399 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACO1P21399 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ACO1P21399 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACO1P21399 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACO1P21399 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACO1P21399 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACO1P21399 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACO1P21399 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACO1P21399 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACO1P21399 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACO1P21399 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACO1P21399 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACO1P21399 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACO1P21399 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACO1P21399 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACO1P21399 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACO1P21399 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACO1P21399 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACO1P21399 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACO1P21399 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACO1P21399 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACO1P21399 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACO1P21399 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACO1P21399 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACO1P21399 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACO1P21399 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACO1P21399 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACO1P21399 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACO1P21399 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACO1P21399 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACO1P21399 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACO1P21399 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACO1P21399 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACO1P21399 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ACO1P21399 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACO1P21399 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACO1P21399 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACO1P21399 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACO1P21399 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACO1P21399 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACO1P21399 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACO1P21399 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACO1P21399 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACO1P21399 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACO1P21399 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACO1P21399 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACO1P21399 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACO1P21399 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACO1P21399 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACO1P21399 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACO1P21399 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ACO1P21399 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ACO1P21399 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACO1P21399 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACO1P21399 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACO1P21399 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACO1P21399 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACO1P21399 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACO1P21399 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACO1P21399 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACO1P21399 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACO1P21399 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACO1P21399 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACO1P21399 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACO1P21399 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACO1P21399 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACO1P21399 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACO1P21399 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACO1P21399 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ACO1P21399 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACO1P21399 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACO1P21399 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACO1P21399 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACO1P21399 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACO1P21399 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACO1P21399 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACO1P21399 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACO1P21399 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACO1P21399 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACO1P21399 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACO1P21399 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACO1P21399 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACO1P21399 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACO1P21399 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACO1P21399 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACO1P21399 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACO1P21399 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACO1P21399 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACO1P21399 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACO1P21399 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACO1P21399 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACO1P21399 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACO1P21399 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ACO1P21399 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ACO1P21399 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACO1P21399 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ACO1P21399 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms