Protein–RNA interactions for Protein: P20963

CD247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD247P20963 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CD247P20963 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CD247P20963 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CD247P20963 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CD247P20963 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CD247P20963 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CD247P20963 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CD247P20963 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CD247P20963 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CD247P20963 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CD247P20963 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CD247P20963 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CD247P20963 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CD247P20963 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CD247P20963 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CD247P20963 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CD247P20963 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CD247P20963 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CD247P20963 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CD247P20963 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CD247P20963 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CD247P20963 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CD247P20963 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CD247P20963 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CD247P20963 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CD247P20963 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CD247P20963 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CD247P20963 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CD247P20963 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CD247P20963 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CD247P20963 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CD247P20963 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CD247P20963 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CD247P20963 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CD247P20963 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CD247P20963 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CD247P20963 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CD247P20963 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CD247P20963 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CD247P20963 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CD247P20963 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CD247P20963 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CD247P20963 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CD247P20963 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CD247P20963 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CD247P20963 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CD247P20963 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CD247P20963 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CD247P20963 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CD247P20963 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CD247P20963 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CD247P20963 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CD247P20963 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CD247P20963 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CD247P20963 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CD247P20963 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CD247P20963 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CD247P20963 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CD247P20963 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CD247P20963 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CD247P20963 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CD247P20963 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CD247P20963 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CD247P20963 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CD247P20963 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CD247P20963 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CD247P20963 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CD247P20963 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CD247P20963 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CD247P20963 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CD247P20963 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CD247P20963 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CD247P20963 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CD247P20963 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CD247P20963 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CD247P20963 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CD247P20963 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CD247P20963 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CD247P20963 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CD247P20963 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CD247P20963 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CD247P20963 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CD247P20963 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CD247P20963 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CD247P20963 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CD247P20963 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CD247P20963 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CD247P20963 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CD247P20963 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CD247P20963 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CD247P20963 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CD247P20963 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CD247P20963 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CD247P20963 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CD247P20963 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CD247P20963 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CD247P20963 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CD247P20963 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CD247P20963 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CD247P20963 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms