Protein–RNA interactions for Protein: P20248

CCNA2, Cyclin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA2P20248 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCNA2P20248 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CCNA2P20248 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCNA2P20248 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCNA2P20248 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CCNA2P20248 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCNA2P20248 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCNA2P20248 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCNA2P20248 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCNA2P20248 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCNA2P20248 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CCNA2P20248 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCNA2P20248 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCNA2P20248 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCNA2P20248 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCNA2P20248 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCNA2P20248 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCNA2P20248 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCNA2P20248 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCNA2P20248 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCNA2P20248 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCNA2P20248 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCNA2P20248 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCNA2P20248 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCNA2P20248 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CCNA2P20248 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCNA2P20248 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCNA2P20248 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCNA2P20248 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCNA2P20248 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCNA2P20248 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCNA2P20248 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCNA2P20248 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCNA2P20248 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCNA2P20248 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCNA2P20248 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCNA2P20248 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCNA2P20248 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCNA2P20248 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCNA2P20248 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCNA2P20248 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CCNA2P20248 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCNA2P20248 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCNA2P20248 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCNA2P20248 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCNA2P20248 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCNA2P20248 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCNA2P20248 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCNA2P20248 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCNA2P20248 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCNA2P20248 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCNA2P20248 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCNA2P20248 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCNA2P20248 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCNA2P20248 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCNA2P20248 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CCNA2P20248 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCNA2P20248 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCNA2P20248 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCNA2P20248 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCNA2P20248 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCNA2P20248 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CCNA2P20248 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CCNA2P20248 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCNA2P20248 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCNA2P20248 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCNA2P20248 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCNA2P20248 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCNA2P20248 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCNA2P20248 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCNA2P20248 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCNA2P20248 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCNA2P20248 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCNA2P20248 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCNA2P20248 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCNA2P20248 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCNA2P20248 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCNA2P20248 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCNA2P20248 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCNA2P20248 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCNA2P20248 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCNA2P20248 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCNA2P20248 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCNA2P20248 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCNA2P20248 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCNA2P20248 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCNA2P20248 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCNA2P20248 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCNA2P20248 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCNA2P20248 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCNA2P20248 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCNA2P20248 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCNA2P20248 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCNA2P20248 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCNA2P20248 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCNA2P20248 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCNA2P20248 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCNA2P20248 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCNA2P20248 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
CCNA2P20248 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms