Protein–RNA interactions for Protein: P20020

ATP2B1, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B1P20020 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATP2B1P20020 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
ATP2B1P20020 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
ATP2B1P20020 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
ATP2B1P20020 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATP2B1P20020 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
ATP2B1P20020 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATP2B1P20020 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATP2B1P20020 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATP2B1P20020 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATP2B1P20020 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP2B1P20020 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP2B1P20020 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP2B1P20020 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP2B1P20020 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP2B1P20020 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP2B1P20020 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP2B1P20020 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP2B1P20020 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP2B1P20020 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP2B1P20020 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP2B1P20020 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP2B1P20020 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP2B1P20020 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP2B1P20020 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP2B1P20020 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP2B1P20020 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP2B1P20020 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP2B1P20020 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP2B1P20020 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP2B1P20020 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP2B1P20020 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP2B1P20020 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP2B1P20020 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP2B1P20020 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP2B1P20020 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP2B1P20020 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP2B1P20020 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP2B1P20020 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP2B1P20020 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP2B1P20020 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP2B1P20020 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP2B1P20020 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP2B1P20020 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATP2B1P20020 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATP2B1P20020 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATP2B1P20020 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATP2B1P20020 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATP2B1P20020 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATP2B1P20020 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATP2B1P20020 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATP2B1P20020 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
ATP2B1P20020 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATP2B1P20020 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATP2B1P20020 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATP2B1P20020 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATP2B1P20020 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATP2B1P20020 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATP2B1P20020 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATP2B1P20020 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATP2B1P20020 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATP2B1P20020 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATP2B1P20020 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATP2B1P20020 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATP2B1P20020 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATP2B1P20020 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATP2B1P20020 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATP2B1P20020 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATP2B1P20020 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATP2B1P20020 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATP2B1P20020 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATP2B1P20020 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATP2B1P20020 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATP2B1P20020 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATP2B1P20020 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATP2B1P20020 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATP2B1P20020 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATP2B1P20020 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATP2B1P20020 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATP2B1P20020 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATP2B1P20020 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATP2B1P20020 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATP2B1P20020 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
ATP2B1P20020 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATP2B1P20020 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATP2B1P20020 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
ATP2B1P20020 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATP2B1P20020 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ATP2B1P20020 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ATP2B1P20020 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATP2B1P20020 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATP2B1P20020 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATP2B1P20020 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATP2B1P20020 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATP2B1P20020 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATP2B1P20020 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATP2B1P20020 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATP2B1P20020 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATP2B1P20020 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATP2B1P20020 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms