Protein–RNA interactions for Protein: P19387

POLR2C, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2CP19387 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLR2CP19387 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLR2CP19387 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLR2CP19387 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLR2CP19387 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLR2CP19387 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLR2CP19387 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLR2CP19387 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLR2CP19387 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLR2CP19387 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLR2CP19387 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLR2CP19387 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLR2CP19387 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLR2CP19387 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLR2CP19387 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLR2CP19387 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLR2CP19387 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLR2CP19387 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLR2CP19387 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLR2CP19387 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLR2CP19387 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLR2CP19387 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLR2CP19387 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLR2CP19387 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLR2CP19387 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLR2CP19387 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLR2CP19387 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLR2CP19387 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR2CP19387 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR2CP19387 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR2CP19387 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR2CP19387 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR2CP19387 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR2CP19387 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR2CP19387 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR2CP19387 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR2CP19387 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR2CP19387 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR2CP19387 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR2CP19387 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR2CP19387 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR2CP19387 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR2CP19387 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR2CP19387 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR2CP19387 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR2CP19387 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR2CP19387 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR2CP19387 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR2CP19387 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR2CP19387 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR2CP19387 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR2CP19387 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR2CP19387 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR2CP19387 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR2CP19387 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR2CP19387 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR2CP19387 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR2CP19387 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR2CP19387 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR2CP19387 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR2CP19387 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR2CP19387 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR2CP19387 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR2CP19387 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR2CP19387 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR2CP19387 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR2CP19387 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR2CP19387 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR2CP19387 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR2CP19387 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR2CP19387 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR2CP19387 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR2CP19387 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR2CP19387 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR2CP19387 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR2CP19387 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR2CP19387 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR2CP19387 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR2CP19387 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR2CP19387 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR2CP19387 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR2CP19387 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLR2CP19387 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLR2CP19387 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLR2CP19387 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLR2CP19387 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLR2CP19387 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLR2CP19387 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
POLR2CP19387 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
POLR2CP19387 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
POLR2CP19387 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
POLR2CP19387 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLR2CP19387 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLR2CP19387 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLR2CP19387 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLR2CP19387 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLR2CP19387 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLR2CP19387 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLR2CP19387 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
POLR2CP19387 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms