Protein–RNA interactions for Protein: P18146

EGR1, Early growth response protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR1P18146 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EGR1P18146 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
EGR1P18146 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EGR1P18146 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
EGR1P18146 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EGR1P18146 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EGR1P18146 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EGR1P18146 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EGR1P18146 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EGR1P18146 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EGR1P18146 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EGR1P18146 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EGR1P18146 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
EGR1P18146 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
EGR1P18146 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
EGR1P18146 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
EGR1P18146 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
EGR1P18146 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EGR1P18146 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EGR1P18146 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EGR1P18146 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EGR1P18146 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EGR1P18146 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EGR1P18146 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EGR1P18146 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EGR1P18146 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EGR1P18146 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EGR1P18146 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EGR1P18146 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EGR1P18146 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EGR1P18146 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EGR1P18146 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EGR1P18146 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EGR1P18146 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EGR1P18146 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EGR1P18146 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EGR1P18146 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EGR1P18146 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EGR1P18146 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EGR1P18146 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EGR1P18146 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EGR1P18146 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EGR1P18146 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
EGR1P18146 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EGR1P18146 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EGR1P18146 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EGR1P18146 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EGR1P18146 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EGR1P18146 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EGR1P18146 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EGR1P18146 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EGR1P18146 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EGR1P18146 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EGR1P18146 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EGR1P18146 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EGR1P18146 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EGR1P18146 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
EGR1P18146 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EGR1P18146 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
EGR1P18146 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EGR1P18146 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
EGR1P18146 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
EGR1P18146 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EGR1P18146 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EGR1P18146 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
EGR1P18146 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
EGR1P18146 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
EGR1P18146 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
EGR1P18146 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EGR1P18146 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EGR1P18146 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EGR1P18146 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EGR1P18146 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EGR1P18146 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EGR1P18146 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EGR1P18146 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EGR1P18146 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EGR1P18146 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
EGR1P18146 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EGR1P18146 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EGR1P18146 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EGR1P18146 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EGR1P18146 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EGR1P18146 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EGR1P18146 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EGR1P18146 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
EGR1P18146 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EGR1P18146 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
EGR1P18146 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EGR1P18146 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EGR1P18146 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EGR1P18146 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EGR1P18146 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EGR1P18146 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EGR1P18146 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
EGR1P18146 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EGR1P18146 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EGR1P18146 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EGR1P18146 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EGR1P18146 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms