Protein–RNA interactions for Protein: P18074

ERCC2, TFIIH basal transcription factor complex helicase XPD subunit, humanhuman

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC2P18074 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ERCC2P18074 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERCC2P18074 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERCC2P18074 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERCC2P18074 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERCC2P18074 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERCC2P18074 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERCC2P18074 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERCC2P18074 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERCC2P18074 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERCC2P18074 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERCC2P18074 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERCC2P18074 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERCC2P18074 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERCC2P18074 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERCC2P18074 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERCC2P18074 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERCC2P18074 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERCC2P18074 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERCC2P18074 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERCC2P18074 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ERCC2P18074 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ERCC2P18074 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ERCC2P18074 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
ERCC2P18074 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ERCC2P18074 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ERCC2P18074 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ERCC2P18074 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ERCC2P18074 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ERCC2P18074 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ERCC2P18074 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ERCC2P18074 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ERCC2P18074 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ERCC2P18074 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ERCC2P18074 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ERCC2P18074 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ERCC2P18074 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ERCC2P18074 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ERCC2P18074 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ERCC2P18074 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERCC2P18074 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERCC2P18074 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERCC2P18074 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERCC2P18074 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERCC2P18074 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERCC2P18074 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERCC2P18074 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERCC2P18074 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ERCC2P18074 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ERCC2P18074 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ERCC2P18074 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERCC2P18074 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERCC2P18074 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERCC2P18074 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERCC2P18074 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERCC2P18074 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERCC2P18074 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERCC2P18074 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERCC2P18074 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERCC2P18074 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERCC2P18074 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERCC2P18074 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ERCC2P18074 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERCC2P18074 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERCC2P18074 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERCC2P18074 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERCC2P18074 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERCC2P18074 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERCC2P18074 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERCC2P18074 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ERCC2P18074 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERCC2P18074 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERCC2P18074 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERCC2P18074 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ERCC2P18074 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERCC2P18074 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERCC2P18074 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERCC2P18074 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERCC2P18074 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERCC2P18074 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERCC2P18074 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERCC2P18074 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERCC2P18074 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERCC2P18074 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERCC2P18074 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERCC2P18074 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERCC2P18074 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERCC2P18074 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERCC2P18074 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERCC2P18074 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERCC2P18074 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERCC2P18074 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERCC2P18074 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERCC2P18074 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERCC2P18074 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERCC2P18074 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERCC2P18074 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERCC2P18074 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERCC2P18074 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERCC2P18074 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms