Protein–RNA interactions for Protein: P18031

PTPN1, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN1P18031 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPN1P18031 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPN1P18031 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPN1P18031 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPN1P18031 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPN1P18031 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPN1P18031 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPN1P18031 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PTPN1P18031 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PTPN1P18031 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PTPN1P18031 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPN1P18031 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPN1P18031 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPN1P18031 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPN1P18031 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPN1P18031 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPN1P18031 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPN1P18031 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPN1P18031 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPN1P18031 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPN1P18031 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPN1P18031 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPN1P18031 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPN1P18031 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPN1P18031 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPN1P18031 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPN1P18031 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPN1P18031 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPN1P18031 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPN1P18031 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPN1P18031 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPN1P18031 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPN1P18031 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPN1P18031 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPN1P18031 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPN1P18031 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPN1P18031 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPN1P18031 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPN1P18031 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPN1P18031 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPN1P18031 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPN1P18031 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPN1P18031 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPN1P18031 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPN1P18031 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPN1P18031 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPN1P18031 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPN1P18031 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPN1P18031 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPN1P18031 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPN1P18031 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPN1P18031 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPN1P18031 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPN1P18031 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPN1P18031 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPN1P18031 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPN1P18031 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPN1P18031 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPN1P18031 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPN1P18031 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPN1P18031 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPN1P18031 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPN1P18031 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPN1P18031 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPN1P18031 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPN1P18031 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPN1P18031 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPN1P18031 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPN1P18031 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPN1P18031 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPN1P18031 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPN1P18031 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPN1P18031 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPN1P18031 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPN1P18031 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPN1P18031 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPN1P18031 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPN1P18031 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPN1P18031 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPN1P18031 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPN1P18031 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPN1P18031 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPN1P18031 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPN1P18031 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPN1P18031 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPN1P18031 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPN1P18031 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPN1P18031 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPN1P18031 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPN1P18031 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPN1P18031 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPN1P18031 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPN1P18031 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPN1P18031 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPN1P18031 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPN1P18031 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPN1P18031 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPN1P18031 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPN1P18031 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PTPN1P18031 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms