Protein–RNA interactions for Protein: P17900

GM2A, Ganglioside GM2 activator, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GM2AP17900 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GM2AP17900 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GM2AP17900 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GM2AP17900 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GM2AP17900 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GM2AP17900 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GM2AP17900 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GM2AP17900 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GM2AP17900 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GM2AP17900 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GM2AP17900 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GM2AP17900 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GM2AP17900 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GM2AP17900 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GM2AP17900 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GM2AP17900 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GM2AP17900 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GM2AP17900 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
GM2AP17900 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GM2AP17900 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GM2AP17900 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GM2AP17900 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GM2AP17900 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GM2AP17900 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GM2AP17900 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GM2AP17900 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GM2AP17900 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GM2AP17900 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GM2AP17900 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GM2AP17900 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GM2AP17900 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GM2AP17900 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GM2AP17900 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GM2AP17900 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
GM2AP17900 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GM2AP17900 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
GM2AP17900 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GM2AP17900 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GM2AP17900 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GM2AP17900 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GM2AP17900 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GM2AP17900 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GM2AP17900 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GM2AP17900 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GM2AP17900 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GM2AP17900 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GM2AP17900 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GM2AP17900 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GM2AP17900 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GM2AP17900 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GM2AP17900 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
GM2AP17900 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GM2AP17900 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
GM2AP17900 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GM2AP17900 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GM2AP17900 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GM2AP17900 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
GM2AP17900 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GM2AP17900 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GM2AP17900 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GM2AP17900 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GM2AP17900 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GM2AP17900 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GM2AP17900 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GM2AP17900 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GM2AP17900 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GM2AP17900 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GM2AP17900 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GM2AP17900 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GM2AP17900 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GM2AP17900 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GM2AP17900 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
GM2AP17900 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GM2AP17900 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GM2AP17900 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GM2AP17900 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GM2AP17900 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
GM2AP17900 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GM2AP17900 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GM2AP17900 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GM2AP17900 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GM2AP17900 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
GM2AP17900 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GM2AP17900 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GM2AP17900 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GM2AP17900 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GM2AP17900 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GM2AP17900 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GM2AP17900 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GM2AP17900 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GM2AP17900 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GM2AP17900 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GM2AP17900 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
GM2AP17900 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GM2AP17900 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GM2AP17900 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GM2AP17900 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GM2AP17900 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GM2AP17900 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GM2AP17900 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms