Protein–RNA interactions for Protein: P17861

XBP1, X-box-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XBP1P17861 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
XBP1P17861 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
XBP1P17861 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
XBP1P17861 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
XBP1P17861 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
XBP1P17861 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
XBP1P17861 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
XBP1P17861 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
XBP1P17861 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
XBP1P17861 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
XBP1P17861 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
XBP1P17861 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
XBP1P17861 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
XBP1P17861 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
XBP1P17861 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
XBP1P17861 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
XBP1P17861 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
XBP1P17861 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
XBP1P17861 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24■■□□□ 1.43
XBP1P17861 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
XBP1P17861 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
XBP1P17861 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
XBP1P17861 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
XBP1P17861 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
XBP1P17861 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
XBP1P17861 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
XBP1P17861 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
XBP1P17861 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
XBP1P17861 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
XBP1P17861 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
XBP1P17861 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
XBP1P17861 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
XBP1P17861 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
XBP1P17861 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
XBP1P17861 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
XBP1P17861 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
XBP1P17861 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
XBP1P17861 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
XBP1P17861 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
XBP1P17861 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
XBP1P17861 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
XBP1P17861 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
XBP1P17861 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
XBP1P17861 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
XBP1P17861 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
XBP1P17861 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
XBP1P17861 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
XBP1P17861 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
XBP1P17861 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
XBP1P17861 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
XBP1P17861 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
XBP1P17861 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
XBP1P17861 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
XBP1P17861 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
XBP1P17861 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
XBP1P17861 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
XBP1P17861 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
XBP1P17861 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
XBP1P17861 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
XBP1P17861 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
XBP1P17861 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
XBP1P17861 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
XBP1P17861 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
XBP1P17861 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
XBP1P17861 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
XBP1P17861 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
XBP1P17861 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
XBP1P17861 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
XBP1P17861 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
XBP1P17861 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
XBP1P17861 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
XBP1P17861 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
XBP1P17861 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
XBP1P17861 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
XBP1P17861 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
XBP1P17861 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
XBP1P17861 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
XBP1P17861 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
XBP1P17861 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
XBP1P17861 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
XBP1P17861 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
XBP1P17861 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
XBP1P17861 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
XBP1P17861 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
XBP1P17861 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
XBP1P17861 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
XBP1P17861 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
XBP1P17861 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
XBP1P17861 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
XBP1P17861 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
XBP1P17861 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
XBP1P17861 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
XBP1P17861 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
XBP1P17861 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
XBP1P17861 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
XBP1P17861 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
XBP1P17861 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
XBP1P17861 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
XBP1P17861 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
XBP1P17861 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms