Protein–RNA interactions for Protein: P17481

HOXB8, Homeobox protein Hox-B8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB8P17481 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22■■□□□ 1.11
HOXB8P17481 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HOXB8P17481 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HOXB8P17481 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22■■□□□ 1.11
HOXB8P17481 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HOXB8P17481 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HOXB8P17481 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HOXB8P17481 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
HOXB8P17481 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HOXB8P17481 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXB8P17481 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXB8P17481 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXB8P17481 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXB8P17481 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXB8P17481 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXB8P17481 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXB8P17481 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXB8P17481 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXB8P17481 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXB8P17481 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXB8P17481 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXB8P17481 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXB8P17481 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXB8P17481 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXB8P17481 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXB8P17481 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXB8P17481 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXB8P17481 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXB8P17481 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXB8P17481 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXB8P17481 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXB8P17481 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXB8P17481 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXB8P17481 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXB8P17481 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXB8P17481 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXB8P17481 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXB8P17481 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXB8P17481 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXB8P17481 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXB8P17481 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXB8P17481 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXB8P17481 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXB8P17481 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXB8P17481 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXB8P17481 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXB8P17481 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXB8P17481 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXB8P17481 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXB8P17481 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXB8P17481 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXB8P17481 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXB8P17481 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXB8P17481 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXB8P17481 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXB8P17481 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXB8P17481 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXB8P17481 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXB8P17481 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXB8P17481 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXB8P17481 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXB8P17481 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXB8P17481 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXB8P17481 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXB8P17481 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXB8P17481 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXB8P17481 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXB8P17481 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXB8P17481 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXB8P17481 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXB8P17481 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXB8P17481 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXB8P17481 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXB8P17481 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
HOXB8P17481 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
HOXB8P17481 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
HOXB8P17481 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXB8P17481 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXB8P17481 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXB8P17481 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXB8P17481 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXB8P17481 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXB8P17481 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXB8P17481 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXB8P17481 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXB8P17481 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXB8P17481 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXB8P17481 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXB8P17481 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXB8P17481 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXB8P17481 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXB8P17481 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXB8P17481 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXB8P17481 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXB8P17481 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXB8P17481 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXB8P17481 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXB8P17481 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXB8P17481 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXB8P17481 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms