Protein–RNA interactions for Protein: P15056

BRAF, Serine/threonine-protein kinase B-raf, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRAFP15056 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
BRAFP15056 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BRAFP15056 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.3■■□□□ 1
BRAFP15056 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
BRAFP15056 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BRAFP15056 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BRAFP15056 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
BRAFP15056 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
BRAFP15056 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BRAFP15056 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
BRAFP15056 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BRAFP15056 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
BRAFP15056 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
BRAFP15056 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
BRAFP15056 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BRAFP15056 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BRAFP15056 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BRAFP15056 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BRAFP15056 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BRAFP15056 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
BRAFP15056 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BRAFP15056 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BRAFP15056 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BRAFP15056 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BRAFP15056 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BRAFP15056 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BRAFP15056 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.28■■□□□ 1
BRAFP15056 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
BRAFP15056 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
BRAFP15056 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
BRAFP15056 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
BRAFP15056 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
BRAFP15056 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
BRAFP15056 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BRAFP15056 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
BRAFP15056 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.28■■□□□ 1
BRAFP15056 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
BRAFP15056 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BRAFP15056 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
BRAFP15056 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BRAFP15056 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
BRAFP15056 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BRAFP15056 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BRAFP15056 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
BRAFP15056 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BRAFP15056 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
BRAFP15056 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
BRAFP15056 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
BRAFP15056 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BRAFP15056 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
BRAFP15056 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BRAFP15056 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BRAFP15056 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BRAFP15056 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BRAFP15056 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BRAFP15056 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BRAFP15056 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BRAFP15056 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BRAFP15056 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BRAFP15056 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BRAFP15056 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BRAFP15056 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BRAFP15056 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BRAFP15056 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BRAFP15056 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
BRAFP15056 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
BRAFP15056 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
BRAFP15056 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BRAFP15056 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BRAFP15056 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BRAFP15056 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BRAFP15056 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BRAFP15056 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BRAFP15056 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BRAFP15056 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BRAFP15056 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BRAFP15056 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BRAFP15056 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BRAFP15056 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BRAFP15056 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BRAFP15056 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BRAFP15056 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BRAFP15056 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BRAFP15056 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BRAFP15056 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BRAFP15056 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BRAFP15056 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BRAFP15056 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BRAFP15056 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BRAFP15056 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BRAFP15056 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
BRAFP15056 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BRAFP15056 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BRAFP15056 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BRAFP15056 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BRAFP15056 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BRAFP15056 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BRAFP15056 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BRAFP15056 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BRAFP15056 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms