Protein–RNA interactions for Protein: P13521

SCG2, Secretogranin-2, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG2P13521 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCG2P13521 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCG2P13521 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCG2P13521 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCG2P13521 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCG2P13521 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCG2P13521 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCG2P13521 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCG2P13521 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCG2P13521 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCG2P13521 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCG2P13521 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCG2P13521 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCG2P13521 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCG2P13521 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCG2P13521 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCG2P13521 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCG2P13521 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCG2P13521 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SCG2P13521 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCG2P13521 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCG2P13521 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCG2P13521 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCG2P13521 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCG2P13521 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCG2P13521 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCG2P13521 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SCG2P13521 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCG2P13521 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCG2P13521 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCG2P13521 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCG2P13521 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCG2P13521 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SCG2P13521 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SCG2P13521 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCG2P13521 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCG2P13521 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SCG2P13521 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCG2P13521 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCG2P13521 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCG2P13521 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCG2P13521 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SCG2P13521 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SCG2P13521 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SCG2P13521 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCG2P13521 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCG2P13521 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCG2P13521 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCG2P13521 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCG2P13521 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCG2P13521 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCG2P13521 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCG2P13521 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCG2P13521 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCG2P13521 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCG2P13521 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCG2P13521 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCG2P13521 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCG2P13521 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCG2P13521 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCG2P13521 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCG2P13521 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCG2P13521 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCG2P13521 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SCG2P13521 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCG2P13521 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCG2P13521 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCG2P13521 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SCG2P13521 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCG2P13521 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCG2P13521 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCG2P13521 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCG2P13521 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCG2P13521 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCG2P13521 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCG2P13521 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCG2P13521 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCG2P13521 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCG2P13521 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCG2P13521 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SCG2P13521 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCG2P13521 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCG2P13521 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCG2P13521 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCG2P13521 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCG2P13521 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCG2P13521 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCG2P13521 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCG2P13521 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCG2P13521 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCG2P13521 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCG2P13521 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCG2P13521 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCG2P13521 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCG2P13521 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCG2P13521 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCG2P13521 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCG2P13521 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCG2P13521 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SCG2P13521 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms