Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
VPREB1P12018 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
VPREB1P12018 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
VPREB1P12018 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
VPREB1P12018 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
VPREB1P12018 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
VPREB1P12018 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
VPREB1P12018 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
VPREB1P12018 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
VPREB1P12018 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
VPREB1P12018 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
VPREB1P12018 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
VPREB1P12018 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
VPREB1P12018 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
VPREB1P12018 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
VPREB1P12018 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
VPREB1P12018 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
VPREB1P12018 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
VPREB1P12018 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
VPREB1P12018 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
VPREB1P12018 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
VPREB1P12018 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
VPREB1P12018 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
VPREB1P12018 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
VPREB1P12018 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
VPREB1P12018 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
VPREB1P12018 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
VPREB1P12018 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
VPREB1P12018 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
VPREB1P12018 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
VPREB1P12018 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
VPREB1P12018 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
VPREB1P12018 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
VPREB1P12018 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
VPREB1P12018 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
VPREB1P12018 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
VPREB1P12018 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
VPREB1P12018 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
VPREB1P12018 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
VPREB1P12018 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
VPREB1P12018 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
VPREB1P12018 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
VPREB1P12018 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
VPREB1P12018 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
VPREB1P12018 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.27
VPREB1P12018 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
VPREB1P12018 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
VPREB1P12018 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
VPREB1P12018 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
VPREB1P12018 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
VPREB1P12018 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
VPREB1P12018 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
VPREB1P12018 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
VPREB1P12018 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
VPREB1P12018 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
VPREB1P12018 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
VPREB1P12018 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
VPREB1P12018 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
VPREB1P12018 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
VPREB1P12018 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
VPREB1P12018 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
VPREB1P12018 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
VPREB1P12018 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
VPREB1P12018 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
VPREB1P12018 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
VPREB1P12018 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
VPREB1P12018 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
VPREB1P12018 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
VPREB1P12018 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
VPREB1P12018 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
VPREB1P12018 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
VPREB1P12018 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
VPREB1P12018 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
VPREB1P12018 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
VPREB1P12018 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
VPREB1P12018 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
VPREB1P12018 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
VPREB1P12018 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
VPREB1P12018 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
VPREB1P12018 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
VPREB1P12018 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
VPREB1P12018 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
VPREB1P12018 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
VPREB1P12018 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
VPREB1P12018 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
VPREB1P12018 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
VPREB1P12018 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
VPREB1P12018 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
VPREB1P12018 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
VPREB1P12018 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
VPREB1P12018 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
VPREB1P12018 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
VPREB1P12018 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
VPREB1P12018 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
VPREB1P12018 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
VPREB1P12018 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
VPREB1P12018 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
VPREB1P12018 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
VPREB1P12018 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
VPREB1P12018 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms