Protein–RNA interactions for Protein: P10826

RARB, Retinoic acid receptor beta, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARBP10826 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RARBP10826 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RARBP10826 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RARBP10826 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RARBP10826 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RARBP10826 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RARBP10826 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RARBP10826 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RARBP10826 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RARBP10826 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RARBP10826 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
RARBP10826 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
RARBP10826 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RARBP10826 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RARBP10826 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RARBP10826 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RARBP10826 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RARBP10826 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RARBP10826 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RARBP10826 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RARBP10826 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RARBP10826 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RARBP10826 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RARBP10826 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RARBP10826 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RARBP10826 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RARBP10826 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RARBP10826 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RARBP10826 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RARBP10826 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RARBP10826 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RARBP10826 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RARBP10826 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RARBP10826 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RARBP10826 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RARBP10826 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RARBP10826 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RARBP10826 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RARBP10826 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RARBP10826 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
RARBP10826 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RARBP10826 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RARBP10826 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
RARBP10826 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RARBP10826 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RARBP10826 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RARBP10826 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RARBP10826 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RARBP10826 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RARBP10826 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RARBP10826 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RARBP10826 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RARBP10826 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RARBP10826 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RARBP10826 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RARBP10826 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RARBP10826 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RARBP10826 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RARBP10826 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RARBP10826 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RARBP10826 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RARBP10826 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
RARBP10826 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RARBP10826 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RARBP10826 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RARBP10826 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RARBP10826 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RARBP10826 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
RARBP10826 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RARBP10826 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RARBP10826 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RARBP10826 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RARBP10826 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RARBP10826 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RARBP10826 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RARBP10826 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RARBP10826 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RARBP10826 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RARBP10826 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
RARBP10826 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RARBP10826 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RARBP10826 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RARBP10826 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RARBP10826 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RARBP10826 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RARBP10826 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RARBP10826 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RARBP10826 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RARBP10826 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RARBP10826 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RARBP10826 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RARBP10826 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RARBP10826 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RARBP10826 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RARBP10826 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RARBP10826 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RARBP10826 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RARBP10826 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
RARBP10826 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RARBP10826 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms