Protein–RNA interactions for Protein: P10070

GLI2, Zinc finger protein GLI2, humanhuman

Predictions only

Length 1,586 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI2P10070 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
GLI2P10070 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
GLI2P10070 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
GLI2P10070 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.75
GLI2P10070 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
GLI2P10070 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
GLI2P10070 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
GLI2P10070 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
GLI2P10070 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
GLI2P10070 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC32.25■■■□□ 2.75
GLI2P10070 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
GLI2P10070 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
GLI2P10070 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
GLI2P10070 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
GLI2P10070 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
GLI2P10070 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
GLI2P10070 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
GLI2P10070 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
GLI2P10070 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
GLI2P10070 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC32.24■■■□□ 2.75
GLI2P10070 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
GLI2P10070 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
GLI2P10070 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.24■■■□□ 2.75
GLI2P10070 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
GLI2P10070 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
GLI2P10070 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
GLI2P10070 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
GLI2P10070 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
GLI2P10070 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC32.23■■■□□ 2.75
GLI2P10070 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC32.23■■■□□ 2.75
GLI2P10070 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
GLI2P10070 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
GLI2P10070 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
GLI2P10070 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
GLI2P10070 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
GLI2P10070 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
GLI2P10070 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
GLI2P10070 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
GLI2P10070 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
GLI2P10070 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
GLI2P10070 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
GLI2P10070 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
GLI2P10070 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
GLI2P10070 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
GLI2P10070 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
GLI2P10070 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
GLI2P10070 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
GLI2P10070 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
GLI2P10070 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
GLI2P10070 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
GLI2P10070 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
GLI2P10070 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
GLI2P10070 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
GLI2P10070 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
GLI2P10070 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
GLI2P10070 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
GLI2P10070 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC32.2■■■□□ 2.75
GLI2P10070 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
GLI2P10070 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
GLI2P10070 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
GLI2P10070 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
GLI2P10070 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
GLI2P10070 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
GLI2P10070 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
GLI2P10070 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
GLI2P10070 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.74
GLI2P10070 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
GLI2P10070 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.2■■■□□ 2.74
GLI2P10070 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC32.2■■■□□ 2.74
GLI2P10070 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
GLI2P10070 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
GLI2P10070 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.19■■■□□ 2.74
GLI2P10070 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
GLI2P10070 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
GLI2P10070 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
GLI2P10070 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
GLI2P10070 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
GLI2P10070 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
GLI2P10070 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
GLI2P10070 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
GLI2P10070 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC32.19■■■□□ 2.74
GLI2P10070 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
GLI2P10070 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
GLI2P10070 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
GLI2P10070 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
GLI2P10070 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC32.19■■■□□ 2.74
GLI2P10070 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.19■■■□□ 2.74
GLI2P10070 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
GLI2P10070 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
GLI2P10070 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC32.18■■■□□ 2.74
GLI2P10070 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
GLI2P10070 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
GLI2P10070 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
GLI2P10070 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
GLI2P10070 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC32.17■■■□□ 2.74
GLI2P10070 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
GLI2P10070 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
GLI2P10070 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
GLI2P10070 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
GLI2P10070 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms