Protein–RNA interactions for Protein: P0DI80

SMIM6, Small integral membrane protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM6P0DI80 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMIM6P0DI80 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMIM6P0DI80 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMIM6P0DI80 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMIM6P0DI80 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMIM6P0DI80 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMIM6P0DI80 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMIM6P0DI80 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMIM6P0DI80 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMIM6P0DI80 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMIM6P0DI80 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMIM6P0DI80 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMIM6P0DI80 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMIM6P0DI80 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMIM6P0DI80 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMIM6P0DI80 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMIM6P0DI80 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMIM6P0DI80 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMIM6P0DI80 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMIM6P0DI80 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMIM6P0DI80 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMIM6P0DI80 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMIM6P0DI80 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMIM6P0DI80 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMIM6P0DI80 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMIM6P0DI80 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMIM6P0DI80 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMIM6P0DI80 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMIM6P0DI80 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMIM6P0DI80 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMIM6P0DI80 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMIM6P0DI80 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMIM6P0DI80 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMIM6P0DI80 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMIM6P0DI80 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMIM6P0DI80 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMIM6P0DI80 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SMIM6P0DI80 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SMIM6P0DI80 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMIM6P0DI80 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMIM6P0DI80 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMIM6P0DI80 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMIM6P0DI80 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMIM6P0DI80 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMIM6P0DI80 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMIM6P0DI80 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMIM6P0DI80 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMIM6P0DI80 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMIM6P0DI80 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMIM6P0DI80 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMIM6P0DI80 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMIM6P0DI80 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMIM6P0DI80 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMIM6P0DI80 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMIM6P0DI80 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMIM6P0DI80 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMIM6P0DI80 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMIM6P0DI80 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMIM6P0DI80 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMIM6P0DI80 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMIM6P0DI80 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMIM6P0DI80 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMIM6P0DI80 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SMIM6P0DI80 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMIM6P0DI80 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMIM6P0DI80 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMIM6P0DI80 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMIM6P0DI80 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMIM6P0DI80 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMIM6P0DI80 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMIM6P0DI80 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMIM6P0DI80 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMIM6P0DI80 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMIM6P0DI80 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMIM6P0DI80 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMIM6P0DI80 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMIM6P0DI80 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMIM6P0DI80 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMIM6P0DI80 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMIM6P0DI80 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMIM6P0DI80 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMIM6P0DI80 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMIM6P0DI80 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMIM6P0DI80 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMIM6P0DI80 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMIM6P0DI80 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMIM6P0DI80 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMIM6P0DI80 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMIM6P0DI80 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMIM6P0DI80 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMIM6P0DI80 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMIM6P0DI80 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMIM6P0DI80 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMIM6P0DI80 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMIM6P0DI80 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMIM6P0DI80 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMIM6P0DI80 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMIM6P0DI80 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SMIM6P0DI80 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMIM6P0DI80 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms