Protein–RNA interactions for Protein: P09341

CXCL1, Growth-regulated alpha protein, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL1P09341 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CXCL1P09341 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CXCL1P09341 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CXCL1P09341 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CXCL1P09341 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CXCL1P09341 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CXCL1P09341 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CXCL1P09341 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CXCL1P09341 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CXCL1P09341 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CXCL1P09341 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CXCL1P09341 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CXCL1P09341 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CXCL1P09341 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CXCL1P09341 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CXCL1P09341 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CXCL1P09341 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CXCL1P09341 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CXCL1P09341 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CXCL1P09341 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CXCL1P09341 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CXCL1P09341 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CXCL1P09341 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CXCL1P09341 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CXCL1P09341 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CXCL1P09341 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CXCL1P09341 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CXCL1P09341 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CXCL1P09341 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CXCL1P09341 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CXCL1P09341 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CXCL1P09341 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CXCL1P09341 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CXCL1P09341 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CXCL1P09341 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CXCL1P09341 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CXCL1P09341 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CXCL1P09341 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CXCL1P09341 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CXCL1P09341 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CXCL1P09341 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CXCL1P09341 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CXCL1P09341 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CXCL1P09341 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CXCL1P09341 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CXCL1P09341 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CXCL1P09341 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CXCL1P09341 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CXCL1P09341 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CXCL1P09341 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CXCL1P09341 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CXCL1P09341 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CXCL1P09341 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CXCL1P09341 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CXCL1P09341 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CXCL1P09341 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CXCL1P09341 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CXCL1P09341 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CXCL1P09341 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CXCL1P09341 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CXCL1P09341 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CXCL1P09341 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CXCL1P09341 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CXCL1P09341 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CXCL1P09341 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CXCL1P09341 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CXCL1P09341 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CXCL1P09341 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CXCL1P09341 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CXCL1P09341 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CXCL1P09341 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CXCL1P09341 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CXCL1P09341 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CXCL1P09341 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CXCL1P09341 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CXCL1P09341 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CXCL1P09341 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CXCL1P09341 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CXCL1P09341 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CXCL1P09341 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CXCL1P09341 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CXCL1P09341 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CXCL1P09341 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CXCL1P09341 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CXCL1P09341 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CXCL1P09341 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CXCL1P09341 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CXCL1P09341 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CXCL1P09341 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CXCL1P09341 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CXCL1P09341 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CXCL1P09341 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CXCL1P09341 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CXCL1P09341 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CXCL1P09341 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CXCL1P09341 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CXCL1P09341 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CXCL1P09341 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CXCL1P09341 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CXCL1P09341 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms