Protein–RNA interactions for Protein: P08603

CFH, Complement factor H, humanhuman

Predictions only

Length 1,231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFHP08603 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CFHP08603 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CFHP08603 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CFHP08603 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CFHP08603 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CFHP08603 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CFHP08603 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CFHP08603 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CFHP08603 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CFHP08603 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CFHP08603 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CFHP08603 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CFHP08603 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CFHP08603 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CFHP08603 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CFHP08603 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CFHP08603 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CFHP08603 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CFHP08603 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CFHP08603 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CFHP08603 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CFHP08603 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CFHP08603 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CFHP08603 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CFHP08603 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CFHP08603 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CFHP08603 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CFHP08603 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CFHP08603 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CFHP08603 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CFHP08603 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CFHP08603 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CFHP08603 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CFHP08603 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CFHP08603 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CFHP08603 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CFHP08603 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CFHP08603 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CFHP08603 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CFHP08603 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CFHP08603 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CFHP08603 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CFHP08603 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CFHP08603 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CFHP08603 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CFHP08603 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CFHP08603 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CFHP08603 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CFHP08603 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CFHP08603 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CFHP08603 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CFHP08603 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CFHP08603 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CFHP08603 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CFHP08603 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CFHP08603 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CFHP08603 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CFHP08603 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CFHP08603 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CFHP08603 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CFHP08603 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CFHP08603 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CFHP08603 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CFHP08603 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CFHP08603 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CFHP08603 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CFHP08603 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CFHP08603 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CFHP08603 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CFHP08603 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CFHP08603 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CFHP08603 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CFHP08603 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CFHP08603 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CFHP08603 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CFHP08603 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CFHP08603 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CFHP08603 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CFHP08603 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CFHP08603 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CFHP08603 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CFHP08603 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CFHP08603 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CFHP08603 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CFHP08603 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CFHP08603 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CFHP08603 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CFHP08603 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CFHP08603 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CFHP08603 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CFHP08603 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CFHP08603 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CFHP08603 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CFHP08603 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CFHP08603 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CFHP08603 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CFHP08603 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CFHP08603 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CFHP08603 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CFHP08603 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms