Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

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Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PTPRCP08575 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PTPRCP08575 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PTPRCP08575 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PTPRCP08575 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PTPRCP08575 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PTPRCP08575 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PTPRCP08575 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PTPRCP08575 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PTPRCP08575 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
PTPRCP08575 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTPRCP08575 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTPRCP08575 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTPRCP08575 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTPRCP08575 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTPRCP08575 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTPRCP08575 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTPRCP08575 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTPRCP08575 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTPRCP08575 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTPRCP08575 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTPRCP08575 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTPRCP08575 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTPRCP08575 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTPRCP08575 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTPRCP08575 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTPRCP08575 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTPRCP08575 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTPRCP08575 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTPRCP08575 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTPRCP08575 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
PTPRCP08575 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTPRCP08575 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTPRCP08575 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
PTPRCP08575 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTPRCP08575 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTPRCP08575 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTPRCP08575 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTPRCP08575 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPRCP08575 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPRCP08575 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPRCP08575 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPRCP08575 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPRCP08575 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPRCP08575 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPRCP08575 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPRCP08575 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPRCP08575 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPRCP08575 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPRCP08575 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPRCP08575 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPRCP08575 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPRCP08575 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTPRCP08575 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTPRCP08575 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTPRCP08575 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTPRCP08575 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTPRCP08575 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTPRCP08575 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTPRCP08575 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
PTPRCP08575 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
PTPRCP08575 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTPRCP08575 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTPRCP08575 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
PTPRCP08575 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTPRCP08575 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTPRCP08575 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
PTPRCP08575 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
PTPRCP08575 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
PTPRCP08575 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPRCP08575 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPRCP08575 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPRCP08575 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPRCP08575 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPRCP08575 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPRCP08575 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPRCP08575 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPRCP08575 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPRCP08575 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPRCP08575 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPRCP08575 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPRCP08575 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPRCP08575 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPRCP08575 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPRCP08575 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPRCP08575 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPRCP08575 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPRCP08575 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPRCP08575 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPRCP08575 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPRCP08575 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPRCP08575 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPRCP08575 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPRCP08575 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPRCP08575 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPRCP08575 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPRCP08575 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPRCP08575 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPRCP08575 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPRCP08575 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
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