Protein–RNA interactions for Protein: O95696

BRD1, Bromodomain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD1O95696 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BRD1O95696 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BRD1O95696 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
BRD1O95696 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
BRD1O95696 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BRD1O95696 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
BRD1O95696 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BRD1O95696 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BRD1O95696 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BRD1O95696 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BRD1O95696 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BRD1O95696 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BRD1O95696 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BRD1O95696 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BRD1O95696 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BRD1O95696 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BRD1O95696 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BRD1O95696 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BRD1O95696 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
BRD1O95696 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
BRD1O95696 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BRD1O95696 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BRD1O95696 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BRD1O95696 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BRD1O95696 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRD1O95696 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRD1O95696 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRD1O95696 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRD1O95696 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRD1O95696 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRD1O95696 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRD1O95696 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRD1O95696 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
BRD1O95696 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRD1O95696 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRD1O95696 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRD1O95696 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRD1O95696 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRD1O95696 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRD1O95696 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRD1O95696 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRD1O95696 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRD1O95696 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRD1O95696 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRD1O95696 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRD1O95696 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRD1O95696 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
BRD1O95696 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRD1O95696 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRD1O95696 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRD1O95696 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRD1O95696 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRD1O95696 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRD1O95696 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRD1O95696 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRD1O95696 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRD1O95696 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRD1O95696 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRD1O95696 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.47
BRD1O95696 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
BRD1O95696 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
BRD1O95696 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BRD1O95696 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BRD1O95696 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
BRD1O95696 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BRD1O95696 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BRD1O95696 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BRD1O95696 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BRD1O95696 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BRD1O95696 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BRD1O95696 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
BRD1O95696 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BRD1O95696 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BRD1O95696 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BRD1O95696 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
BRD1O95696 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
BRD1O95696 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BRD1O95696 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BRD1O95696 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BRD1O95696 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BRD1O95696 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BRD1O95696 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BRD1O95696 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BRD1O95696 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BRD1O95696 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BRD1O95696 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BRD1O95696 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BRD1O95696 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BRD1O95696 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BRD1O95696 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BRD1O95696 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BRD1O95696 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BRD1O95696 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BRD1O95696 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BRD1O95696 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BRD1O95696 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BRD1O95696 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BRD1O95696 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BRD1O95696 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BRD1O95696 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms