Protein–RNA interactions for Protein: O95295

SNAPIN, SNARE-associated protein Snapin, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPINO95295 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNAPINO95295 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNAPINO95295 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNAPINO95295 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNAPINO95295 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNAPINO95295 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SNAPINO95295 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SNAPINO95295 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNAPINO95295 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SNAPINO95295 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNAPINO95295 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNAPINO95295 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNAPINO95295 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNAPINO95295 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNAPINO95295 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNAPINO95295 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNAPINO95295 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNAPINO95295 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNAPINO95295 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNAPINO95295 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNAPINO95295 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNAPINO95295 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNAPINO95295 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNAPINO95295 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNAPINO95295 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNAPINO95295 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNAPINO95295 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNAPINO95295 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNAPINO95295 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNAPINO95295 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNAPINO95295 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNAPINO95295 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNAPINO95295 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNAPINO95295 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNAPINO95295 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNAPINO95295 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNAPINO95295 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNAPINO95295 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNAPINO95295 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNAPINO95295 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNAPINO95295 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNAPINO95295 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNAPINO95295 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNAPINO95295 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNAPINO95295 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNAPINO95295 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNAPINO95295 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNAPINO95295 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNAPINO95295 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNAPINO95295 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNAPINO95295 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNAPINO95295 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SNAPINO95295 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
SNAPINO95295 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SNAPINO95295 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SNAPINO95295 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SNAPINO95295 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SNAPINO95295 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SNAPINO95295 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SNAPINO95295 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SNAPINO95295 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SNAPINO95295 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SNAPINO95295 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SNAPINO95295 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SNAPINO95295 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNAPINO95295 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNAPINO95295 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNAPINO95295 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNAPINO95295 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNAPINO95295 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNAPINO95295 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNAPINO95295 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNAPINO95295 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNAPINO95295 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNAPINO95295 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNAPINO95295 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNAPINO95295 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNAPINO95295 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNAPINO95295 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SNAPINO95295 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNAPINO95295 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNAPINO95295 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SNAPINO95295 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNAPINO95295 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNAPINO95295 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNAPINO95295 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNAPINO95295 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNAPINO95295 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNAPINO95295 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNAPINO95295 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNAPINO95295 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNAPINO95295 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNAPINO95295 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNAPINO95295 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNAPINO95295 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNAPINO95295 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNAPINO95295 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNAPINO95295 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNAPINO95295 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SNAPINO95295 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms