Protein–RNA interactions for Protein: O75884

RBBP9, Putative hydrolase RBBP9, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP9O75884 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RBBP9O75884 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RBBP9O75884 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RBBP9O75884 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RBBP9O75884 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RBBP9O75884 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RBBP9O75884 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RBBP9O75884 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RBBP9O75884 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RBBP9O75884 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RBBP9O75884 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RBBP9O75884 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RBBP9O75884 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RBBP9O75884 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RBBP9O75884 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RBBP9O75884 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RBBP9O75884 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RBBP9O75884 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RBBP9O75884 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RBBP9O75884 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
RBBP9O75884 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
RBBP9O75884 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
RBBP9O75884 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
RBBP9O75884 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RBBP9O75884 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RBBP9O75884 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RBBP9O75884 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RBBP9O75884 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RBBP9O75884 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RBBP9O75884 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RBBP9O75884 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RBBP9O75884 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RBBP9O75884 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RBBP9O75884 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RBBP9O75884 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RBBP9O75884 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RBBP9O75884 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
RBBP9O75884 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RBBP9O75884 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
RBBP9O75884 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RBBP9O75884 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RBBP9O75884 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RBBP9O75884 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RBBP9O75884 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RBBP9O75884 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RBBP9O75884 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RBBP9O75884 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RBBP9O75884 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RBBP9O75884 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RBBP9O75884 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
RBBP9O75884 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RBBP9O75884 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RBBP9O75884 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RBBP9O75884 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RBBP9O75884 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RBBP9O75884 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RBBP9O75884 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RBBP9O75884 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RBBP9O75884 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RBBP9O75884 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RBBP9O75884 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RBBP9O75884 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RBBP9O75884 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RBBP9O75884 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RBBP9O75884 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RBBP9O75884 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RBBP9O75884 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RBBP9O75884 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RBBP9O75884 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RBBP9O75884 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RBBP9O75884 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RBBP9O75884 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RBBP9O75884 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
RBBP9O75884 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RBBP9O75884 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RBBP9O75884 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RBBP9O75884 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
RBBP9O75884 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RBBP9O75884 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RBBP9O75884 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RBBP9O75884 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RBBP9O75884 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RBBP9O75884 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RBBP9O75884 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RBBP9O75884 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RBBP9O75884 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RBBP9O75884 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RBBP9O75884 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RBBP9O75884 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RBBP9O75884 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RBBP9O75884 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RBBP9O75884 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RBBP9O75884 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RBBP9O75884 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RBBP9O75884 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RBBP9O75884 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RBBP9O75884 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RBBP9O75884 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RBBP9O75884 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RBBP9O75884 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms