Protein–RNA interactions for Protein: O75808

CAPN15, Calpain-15, humanhuman

Predictions only

Length 1,086 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN15O75808 AL365223.1-201ENST00000574864 1297 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CAPN15O75808 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CAPN15O75808 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CAPN15O75808 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CAPN15O75808 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CAPN15O75808 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CAPN15O75808 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CAPN15O75808 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CAPN15O75808 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CAPN15O75808 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CAPN15O75808 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CAPN15O75808 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CAPN15O75808 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CAPN15O75808 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CAPN15O75808 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CAPN15O75808 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CAPN15O75808 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CAPN15O75808 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CAPN15O75808 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CAPN15O75808 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CAPN15O75808 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CAPN15O75808 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CAPN15O75808 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CAPN15O75808 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CAPN15O75808 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CAPN15O75808 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CAPN15O75808 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CAPN15O75808 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAPN15O75808 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAPN15O75808 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAPN15O75808 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CAPN15O75808 AC091917.2-201ENST00000505002 744 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CAPN15O75808 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAPN15O75808 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAPN15O75808 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAPN15O75808 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAPN15O75808 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAPN15O75808 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CAPN15O75808 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CAPN15O75808 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CAPN15O75808 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CAPN15O75808 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CAPN15O75808 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CAPN15O75808 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CAPN15O75808 EIF2S2P5-201ENST00000457635 968 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CAPN15O75808 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CAPN15O75808 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CAPN15O75808 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CAPN15O75808 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CAPN15O75808 AC010326.4-201ENST00000604665 891 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CAPN15O75808 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CAPN15O75808 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CAPN15O75808 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CAPN15O75808 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CAPN15O75808 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CAPN15O75808 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CAPN15O75808 AL109935.1-201ENST00000413249 473 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CAPN15O75808 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CAPN15O75808 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CAPN15O75808 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CAPN15O75808 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CAPN15O75808 AC103798.2-201ENST00000624292 632 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CAPN15O75808 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CAPN15O75808 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CAPN15O75808 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CAPN15O75808 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CAPN15O75808 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CAPN15O75808 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CAPN15O75808 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CAPN15O75808 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CAPN15O75808 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CAPN15O75808 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CAPN15O75808 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CAPN15O75808 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CAPN15O75808 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CAPN15O75808 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CAPN15O75808 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CAPN15O75808 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CAPN15O75808 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CAPN15O75808 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CAPN15O75808 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CAPN15O75808 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CAPN15O75808 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CAPN15O75808 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CAPN15O75808 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CAPN15O75808 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CAPN15O75808 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CAPN15O75808 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CAPN15O75808 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CAPN15O75808 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CAPN15O75808 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CAPN15O75808 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CAPN15O75808 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CAPN15O75808 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CAPN15O75808 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CAPN15O75808 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CAPN15O75808 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CAPN15O75808 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CAPN15O75808 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CAPN15O75808 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms