Protein–RNA interactions for Protein: O75762

TRPA1, Transient receptor potential cation channel subfamily A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPA1O75762 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRPA1O75762 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRPA1O75762 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRPA1O75762 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TRPA1O75762 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRPA1O75762 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRPA1O75762 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRPA1O75762 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRPA1O75762 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRPA1O75762 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRPA1O75762 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TRPA1O75762 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRPA1O75762 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TRPA1O75762 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRPA1O75762 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRPA1O75762 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRPA1O75762 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRPA1O75762 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRPA1O75762 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRPA1O75762 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRPA1O75762 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRPA1O75762 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRPA1O75762 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRPA1O75762 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRPA1O75762 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRPA1O75762 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRPA1O75762 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRPA1O75762 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRPA1O75762 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRPA1O75762 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRPA1O75762 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRPA1O75762 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRPA1O75762 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRPA1O75762 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRPA1O75762 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRPA1O75762 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRPA1O75762 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRPA1O75762 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRPA1O75762 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRPA1O75762 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRPA1O75762 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRPA1O75762 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRPA1O75762 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRPA1O75762 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRPA1O75762 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRPA1O75762 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRPA1O75762 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRPA1O75762 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRPA1O75762 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRPA1O75762 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRPA1O75762 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRPA1O75762 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TRPA1O75762 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRPA1O75762 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRPA1O75762 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRPA1O75762 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRPA1O75762 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TRPA1O75762 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TRPA1O75762 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TRPA1O75762 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TRPA1O75762 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TRPA1O75762 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TRPA1O75762 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRPA1O75762 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRPA1O75762 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRPA1O75762 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRPA1O75762 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRPA1O75762 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRPA1O75762 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRPA1O75762 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRPA1O75762 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRPA1O75762 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRPA1O75762 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TRPA1O75762 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRPA1O75762 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRPA1O75762 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRPA1O75762 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRPA1O75762 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRPA1O75762 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRPA1O75762 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRPA1O75762 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRPA1O75762 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRPA1O75762 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRPA1O75762 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRPA1O75762 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRPA1O75762 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRPA1O75762 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TRPA1O75762 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRPA1O75762 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRPA1O75762 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRPA1O75762 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRPA1O75762 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRPA1O75762 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRPA1O75762 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRPA1O75762 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRPA1O75762 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRPA1O75762 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRPA1O75762 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRPA1O75762 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRPA1O75762 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms