Protein–RNA interactions for Protein: O75607

NPM3, Nucleoplasmin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPM3O75607 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NPM3O75607 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NPM3O75607 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
NPM3O75607 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NPM3O75607 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NPM3O75607 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
NPM3O75607 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NPM3O75607 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NPM3O75607 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NPM3O75607 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NPM3O75607 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NPM3O75607 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NPM3O75607 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NPM3O75607 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
NPM3O75607 HSFY1P1-201ENST00000423928 1178 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
NPM3O75607 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NPM3O75607 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NPM3O75607 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NPM3O75607 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NPM3O75607 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NPM3O75607 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NPM3O75607 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NPM3O75607 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NPM3O75607 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NPM3O75607 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NPM3O75607 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NPM3O75607 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NPM3O75607 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NPM3O75607 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NPM3O75607 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
NPM3O75607 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
NPM3O75607 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NPM3O75607 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NPM3O75607 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NPM3O75607 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NPM3O75607 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NPM3O75607 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
NPM3O75607 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NPM3O75607 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NPM3O75607 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NPM3O75607 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NPM3O75607 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NPM3O75607 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NPM3O75607 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NPM3O75607 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NPM3O75607 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NPM3O75607 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NPM3O75607 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NPM3O75607 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NPM3O75607 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NPM3O75607 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NPM3O75607 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NPM3O75607 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NPM3O75607 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NPM3O75607 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NPM3O75607 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NPM3O75607 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NPM3O75607 AC010422.1-201ENST00000414548 543 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NPM3O75607 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NPM3O75607 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NPM3O75607 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NPM3O75607 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NPM3O75607 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NPM3O75607 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NPM3O75607 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NPM3O75607 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NPM3O75607 AC012370.2-204ENST00000601940 1320 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NPM3O75607 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NPM3O75607 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
NPM3O75607 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NPM3O75607 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NPM3O75607 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NPM3O75607 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NPM3O75607 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
NPM3O75607 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NPM3O75607 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
NPM3O75607 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NPM3O75607 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NPM3O75607 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NPM3O75607 AC105148.1-201ENST00000604961 409 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
NPM3O75607 AC027281.2-201ENST00000623856 713 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
NPM3O75607 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NPM3O75607 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NPM3O75607 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NPM3O75607 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NPM3O75607 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NPM3O75607 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NPM3O75607 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
NPM3O75607 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
NPM3O75607 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
NPM3O75607 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NPM3O75607 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NPM3O75607 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NPM3O75607 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NPM3O75607 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NPM3O75607 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NPM3O75607 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NPM3O75607 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NPM3O75607 PPP1R42-212ENST00000522909 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NPM3O75607 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms