Protein–RNA interactions for Protein: O75379

VAMP4, Vesicle-associated membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP4O75379 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
VAMP4O75379 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
VAMP4O75379 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
VAMP4O75379 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
VAMP4O75379 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
VAMP4O75379 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
VAMP4O75379 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
VAMP4O75379 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
VAMP4O75379 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
VAMP4O75379 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
VAMP4O75379 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
VAMP4O75379 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
VAMP4O75379 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
VAMP4O75379 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
VAMP4O75379 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
VAMP4O75379 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
VAMP4O75379 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
VAMP4O75379 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
VAMP4O75379 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
VAMP4O75379 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
VAMP4O75379 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
VAMP4O75379 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
VAMP4O75379 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
VAMP4O75379 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
VAMP4O75379 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
VAMP4O75379 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
VAMP4O75379 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
VAMP4O75379 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
VAMP4O75379 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
VAMP4O75379 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
VAMP4O75379 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
VAMP4O75379 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
VAMP4O75379 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
VAMP4O75379 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
VAMP4O75379 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
VAMP4O75379 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
VAMP4O75379 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
VAMP4O75379 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
VAMP4O75379 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
VAMP4O75379 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
VAMP4O75379 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
VAMP4O75379 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
VAMP4O75379 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
VAMP4O75379 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
VAMP4O75379 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
VAMP4O75379 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
VAMP4O75379 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
VAMP4O75379 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
VAMP4O75379 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
VAMP4O75379 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
VAMP4O75379 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
VAMP4O75379 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
VAMP4O75379 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
VAMP4O75379 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
VAMP4O75379 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
VAMP4O75379 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
VAMP4O75379 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
VAMP4O75379 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
VAMP4O75379 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
VAMP4O75379 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
VAMP4O75379 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
VAMP4O75379 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
VAMP4O75379 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
VAMP4O75379 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
VAMP4O75379 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
VAMP4O75379 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
VAMP4O75379 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
VAMP4O75379 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
VAMP4O75379 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
VAMP4O75379 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
VAMP4O75379 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
VAMP4O75379 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
VAMP4O75379 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
VAMP4O75379 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
VAMP4O75379 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
VAMP4O75379 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
VAMP4O75379 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
VAMP4O75379 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
VAMP4O75379 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
VAMP4O75379 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
VAMP4O75379 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
VAMP4O75379 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
VAMP4O75379 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
VAMP4O75379 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
VAMP4O75379 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
VAMP4O75379 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
VAMP4O75379 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
VAMP4O75379 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
VAMP4O75379 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
VAMP4O75379 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
VAMP4O75379 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
VAMP4O75379 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
VAMP4O75379 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
VAMP4O75379 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
VAMP4O75379 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
VAMP4O75379 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
VAMP4O75379 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
VAMP4O75379 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
VAMP4O75379 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
VAMP4O75379 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms