Protein–RNA interactions for Protein: O60575

SPINK4, Serine protease inhibitor Kazal-type 4, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPINK4O60575 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPINK4O60575 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPINK4O60575 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPINK4O60575 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPINK4O60575 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPINK4O60575 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPINK4O60575 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SPINK4O60575 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPINK4O60575 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPINK4O60575 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPINK4O60575 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPINK4O60575 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPINK4O60575 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPINK4O60575 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPINK4O60575 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPINK4O60575 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPINK4O60575 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPINK4O60575 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPINK4O60575 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPINK4O60575 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPINK4O60575 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPINK4O60575 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPINK4O60575 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPINK4O60575 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPINK4O60575 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPINK4O60575 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPINK4O60575 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPINK4O60575 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPINK4O60575 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPINK4O60575 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPINK4O60575 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPINK4O60575 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPINK4O60575 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPINK4O60575 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPINK4O60575 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPINK4O60575 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPINK4O60575 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPINK4O60575 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPINK4O60575 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPINK4O60575 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPINK4O60575 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPINK4O60575 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPINK4O60575 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPINK4O60575 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPINK4O60575 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPINK4O60575 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPINK4O60575 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPINK4O60575 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPINK4O60575 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPINK4O60575 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPINK4O60575 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPINK4O60575 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPINK4O60575 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPINK4O60575 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPINK4O60575 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPINK4O60575 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPINK4O60575 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPINK4O60575 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPINK4O60575 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPINK4O60575 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPINK4O60575 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPINK4O60575 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPINK4O60575 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPINK4O60575 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPINK4O60575 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPINK4O60575 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPINK4O60575 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPINK4O60575 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPINK4O60575 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPINK4O60575 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPINK4O60575 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SPINK4O60575 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPINK4O60575 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPINK4O60575 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPINK4O60575 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPINK4O60575 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPINK4O60575 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPINK4O60575 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SPINK4O60575 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPINK4O60575 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPINK4O60575 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPINK4O60575 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SPINK4O60575 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPINK4O60575 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SPINK4O60575 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SPINK4O60575 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPINK4O60575 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPINK4O60575 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPINK4O60575 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPINK4O60575 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPINK4O60575 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SPINK4O60575 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPINK4O60575 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPINK4O60575 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPINK4O60575 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPINK4O60575 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPINK4O60575 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPINK4O60575 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPINK4O60575 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPINK4O60575 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms