Protein–RNA interactions for Protein: O43921

EFNA2, Ephrin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA2O43921 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EFNA2O43921 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
EFNA2O43921 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
EFNA2O43921 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
EFNA2O43921 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EFNA2O43921 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EFNA2O43921 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
EFNA2O43921 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
EFNA2O43921 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EFNA2O43921 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
EFNA2O43921 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EFNA2O43921 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
EFNA2O43921 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
EFNA2O43921 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
EFNA2O43921 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EFNA2O43921 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
EFNA2O43921 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EFNA2O43921 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
EFNA2O43921 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EFNA2O43921 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EFNA2O43921 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EFNA2O43921 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
EFNA2O43921 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
EFNA2O43921 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
EFNA2O43921 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EFNA2O43921 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
EFNA2O43921 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
EFNA2O43921 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EFNA2O43921 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
EFNA2O43921 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
EFNA2O43921 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
EFNA2O43921 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EFNA2O43921 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EFNA2O43921 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
EFNA2O43921 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EFNA2O43921 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EFNA2O43921 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EFNA2O43921 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EFNA2O43921 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EFNA2O43921 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
EFNA2O43921 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EFNA2O43921 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EFNA2O43921 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
EFNA2O43921 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EFNA2O43921 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
EFNA2O43921 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EFNA2O43921 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
EFNA2O43921 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
EFNA2O43921 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
EFNA2O43921 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EFNA2O43921 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
EFNA2O43921 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
EFNA2O43921 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
EFNA2O43921 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EFNA2O43921 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EFNA2O43921 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
EFNA2O43921 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EFNA2O43921 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EFNA2O43921 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
EFNA2O43921 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
EFNA2O43921 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EFNA2O43921 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
EFNA2O43921 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
EFNA2O43921 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
EFNA2O43921 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EFNA2O43921 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
EFNA2O43921 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
EFNA2O43921 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EFNA2O43921 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EFNA2O43921 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EFNA2O43921 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
EFNA2O43921 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EFNA2O43921 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
EFNA2O43921 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
EFNA2O43921 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
EFNA2O43921 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
EFNA2O43921 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
EFNA2O43921 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
EFNA2O43921 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
EFNA2O43921 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
EFNA2O43921 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
EFNA2O43921 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
EFNA2O43921 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
EFNA2O43921 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
EFNA2O43921 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
EFNA2O43921 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
EFNA2O43921 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
EFNA2O43921 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
EFNA2O43921 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
EFNA2O43921 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
EFNA2O43921 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
EFNA2O43921 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
EFNA2O43921 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
EFNA2O43921 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
EFNA2O43921 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
EFNA2O43921 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
EFNA2O43921 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
EFNA2O43921 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
EFNA2O43921 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
EFNA2O43921 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms