Protein–RNA interactions for Protein: O43854

EDIL3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDIL3O43854 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
EDIL3O43854 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
EDIL3O43854 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
EDIL3O43854 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
EDIL3O43854 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
EDIL3O43854 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
EDIL3O43854 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EDIL3O43854 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EDIL3O43854 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EDIL3O43854 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EDIL3O43854 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EDIL3O43854 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EDIL3O43854 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EDIL3O43854 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EDIL3O43854 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EDIL3O43854 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EDIL3O43854 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EDIL3O43854 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EDIL3O43854 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EDIL3O43854 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EDIL3O43854 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EDIL3O43854 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EDIL3O43854 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EDIL3O43854 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EDIL3O43854 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
EDIL3O43854 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EDIL3O43854 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EDIL3O43854 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
EDIL3O43854 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EDIL3O43854 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EDIL3O43854 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
EDIL3O43854 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EDIL3O43854 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EDIL3O43854 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EDIL3O43854 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EDIL3O43854 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EDIL3O43854 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EDIL3O43854 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EDIL3O43854 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EDIL3O43854 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EDIL3O43854 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EDIL3O43854 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EDIL3O43854 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EDIL3O43854 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
EDIL3O43854 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EDIL3O43854 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EDIL3O43854 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EDIL3O43854 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EDIL3O43854 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EDIL3O43854 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
EDIL3O43854 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EDIL3O43854 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EDIL3O43854 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EDIL3O43854 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EDIL3O43854 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EDIL3O43854 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EDIL3O43854 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EDIL3O43854 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EDIL3O43854 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EDIL3O43854 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EDIL3O43854 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EDIL3O43854 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EDIL3O43854 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EDIL3O43854 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EDIL3O43854 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EDIL3O43854 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EDIL3O43854 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
EDIL3O43854 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
EDIL3O43854 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EDIL3O43854 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EDIL3O43854 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
EDIL3O43854 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EDIL3O43854 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EDIL3O43854 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EDIL3O43854 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EDIL3O43854 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EDIL3O43854 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EDIL3O43854 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EDIL3O43854 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EDIL3O43854 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EDIL3O43854 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EDIL3O43854 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EDIL3O43854 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EDIL3O43854 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EDIL3O43854 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EDIL3O43854 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
EDIL3O43854 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EDIL3O43854 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EDIL3O43854 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EDIL3O43854 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EDIL3O43854 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
EDIL3O43854 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EDIL3O43854 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
EDIL3O43854 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
EDIL3O43854 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EDIL3O43854 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EDIL3O43854 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EDIL3O43854 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EDIL3O43854 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EDIL3O43854 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms