Protein–RNA interactions for Protein: O43583

DENR, Density-regulated protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENRO43583 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
DENRO43583 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
DENRO43583 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
DENRO43583 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
DENRO43583 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
DENRO43583 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
DENRO43583 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
DENRO43583 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
DENRO43583 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
DENRO43583 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
DENRO43583 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DENRO43583 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
DENRO43583 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
DENRO43583 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DENRO43583 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
DENRO43583 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DENRO43583 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
DENRO43583 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DENRO43583 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DENRO43583 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DENRO43583 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DENRO43583 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DENRO43583 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
DENRO43583 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DENRO43583 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DENRO43583 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DENRO43583 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DENRO43583 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
DENRO43583 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
DENRO43583 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DENRO43583 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DENRO43583 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DENRO43583 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
DENRO43583 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
DENRO43583 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
DENRO43583 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DENRO43583 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
DENRO43583 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DENRO43583 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DENRO43583 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DENRO43583 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
DENRO43583 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DENRO43583 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
DENRO43583 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
DENRO43583 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
DENRO43583 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DENRO43583 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
DENRO43583 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
DENRO43583 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
DENRO43583 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DENRO43583 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DENRO43583 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
DENRO43583 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
DENRO43583 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
DENRO43583 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DENRO43583 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
DENRO43583 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DENRO43583 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DENRO43583 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DENRO43583 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
DENRO43583 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
DENRO43583 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DENRO43583 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
DENRO43583 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
DENRO43583 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DENRO43583 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DENRO43583 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
DENRO43583 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
DENRO43583 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DENRO43583 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
DENRO43583 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DENRO43583 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DENRO43583 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
DENRO43583 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
DENRO43583 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DENRO43583 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DENRO43583 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
DENRO43583 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DENRO43583 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.66
DENRO43583 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
DENRO43583 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
DENRO43583 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DENRO43583 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DENRO43583 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
DENRO43583 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
DENRO43583 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
DENRO43583 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DENRO43583 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
DENRO43583 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DENRO43583 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DENRO43583 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
DENRO43583 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DENRO43583 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DENRO43583 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DENRO43583 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DENRO43583 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DENRO43583 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
DENRO43583 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
DENRO43583 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
DENRO43583 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms