Protein–RNA interactions for Protein: O15504

NUPL2, Nucleoporin-like protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUPL2O15504 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NUPL2O15504 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NUPL2O15504 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NUPL2O15504 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NUPL2O15504 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NUPL2O15504 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NUPL2O15504 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
NUPL2O15504 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NUPL2O15504 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
NUPL2O15504 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NUPL2O15504 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NUPL2O15504 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NUPL2O15504 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NUPL2O15504 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NUPL2O15504 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NUPL2O15504 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NUPL2O15504 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NUPL2O15504 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NUPL2O15504 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NUPL2O15504 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NUPL2O15504 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NUPL2O15504 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NUPL2O15504 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NUPL2O15504 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NUPL2O15504 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NUPL2O15504 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUPL2O15504 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUPL2O15504 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUPL2O15504 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUPL2O15504 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUPL2O15504 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUPL2O15504 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUPL2O15504 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUPL2O15504 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUPL2O15504 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
NUPL2O15504 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
NUPL2O15504 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUPL2O15504 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUPL2O15504 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUPL2O15504 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUPL2O15504 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUPL2O15504 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUPL2O15504 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUPL2O15504 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUPL2O15504 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUPL2O15504 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUPL2O15504 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUPL2O15504 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NUPL2O15504 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NUPL2O15504 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
NUPL2O15504 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NUPL2O15504 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NUPL2O15504 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NUPL2O15504 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NUPL2O15504 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NUPL2O15504 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NUPL2O15504 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
NUPL2O15504 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NUPL2O15504 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NUPL2O15504 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NUPL2O15504 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NUPL2O15504 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NUPL2O15504 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NUPL2O15504 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NUPL2O15504 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NUPL2O15504 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NUPL2O15504 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NUPL2O15504 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NUPL2O15504 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NUPL2O15504 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NUPL2O15504 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NUPL2O15504 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NUPL2O15504 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NUPL2O15504 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NUPL2O15504 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NUPL2O15504 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NUPL2O15504 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NUPL2O15504 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NUPL2O15504 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NUPL2O15504 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NUPL2O15504 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NUPL2O15504 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NUPL2O15504 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NUPL2O15504 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NUPL2O15504 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NUPL2O15504 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NUPL2O15504 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NUPL2O15504 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NUPL2O15504 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NUPL2O15504 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NUPL2O15504 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NUPL2O15504 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
NUPL2O15504 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
NUPL2O15504 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
NUPL2O15504 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
NUPL2O15504 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
NUPL2O15504 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
NUPL2O15504 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
NUPL2O15504 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NUPL2O15504 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms