Protein–RNA interactions for Protein: O15061

SYNM, Synemin, humanhuman

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNMO15061 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
SYNMO15061 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
SYNMO15061 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
SYNMO15061 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC30.26■■■□□ 2.43
SYNMO15061 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC30.26■■■□□ 2.43
SYNMO15061 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
SYNMO15061 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
SYNMO15061 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
SYNMO15061 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
SYNMO15061 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
SYNMO15061 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
SYNMO15061 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
SYNMO15061 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
SYNMO15061 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
SYNMO15061 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
SYNMO15061 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
SYNMO15061 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
SYNMO15061 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
SYNMO15061 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
SYNMO15061 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
SYNMO15061 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
SYNMO15061 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
SYNMO15061 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
SYNMO15061 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
SYNMO15061 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
SYNMO15061 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
SYNMO15061 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
SYNMO15061 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
SYNMO15061 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
SYNMO15061 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
SYNMO15061 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
SYNMO15061 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
SYNMO15061 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
SYNMO15061 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
SYNMO15061 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
SYNMO15061 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
SYNMO15061 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
SYNMO15061 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
SYNMO15061 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
SYNMO15061 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
SYNMO15061 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
SYNMO15061 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
SYNMO15061 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
SYNMO15061 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
SYNMO15061 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
SYNMO15061 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
SYNMO15061 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
SYNMO15061 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
SYNMO15061 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
SYNMO15061 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
SYNMO15061 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
SYNMO15061 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
SYNMO15061 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
SYNMO15061 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
SYNMO15061 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
SYNMO15061 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
SYNMO15061 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
SYNMO15061 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
SYNMO15061 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
SYNMO15061 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
SYNMO15061 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
SYNMO15061 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
SYNMO15061 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
SYNMO15061 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
SYNMO15061 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
SYNMO15061 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
SYNMO15061 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC30.21■■■□□ 2.43
SYNMO15061 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
SYNMO15061 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
SYNMO15061 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC30.21■■■□□ 2.43
SYNMO15061 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
SYNMO15061 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
SYNMO15061 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
SYNMO15061 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
SYNMO15061 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
SYNMO15061 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
SYNMO15061 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
SYNMO15061 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
SYNMO15061 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
SYNMO15061 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.43
SYNMO15061 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
SYNMO15061 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
SYNMO15061 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.43
SYNMO15061 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
SYNMO15061 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
SYNMO15061 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
SYNMO15061 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC30.2■■■□□ 2.42
SYNMO15061 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC30.2■■■□□ 2.42
SYNMO15061 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
SYNMO15061 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
SYNMO15061 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
SYNMO15061 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
SYNMO15061 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
SYNMO15061 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
SYNMO15061 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
SYNMO15061 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
SYNMO15061 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
SYNMO15061 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
SYNMO15061 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
SYNMO15061 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms